En la inhibición irreversible de las enzimas, ¿sigue siendo significativa la IC50 para el inhibidor irreversible?

Esta es una excelente pregunta. El concepto de IC50 es en gran medida sin sentido ya que se aplica a los inhibidores irreversibles. La razón es que, siempre que la concentración de inhibidor exceda a la de la enzima, cualquier concentración de inhibidor dará como resultado 100% de inhibición si se incuba (in vitro) durante el tiempo suficiente para que la reacción irreversible llegue a completarse. Como dices en tu pregunta, si se permite que la reacción se complete, entonces la IC50 simplemente equivaldrá a la mitad de la concentración total de la enzima. Si la reacción se incuba durante un tiempo más corto, entonces el IC50 será un número mayor, pero puede tener un valor mayor dependiendo del tiempo de incubación. En consecuencia, con un inhibidor irreversible es posible hacer que el IC50 obtenga literalmente cualquier valor que desee, simplemente cambiando la concentración de enzima y el tiempo de incubación.

En el mejor de los casos, un valor IC50 medido para un inhibidor irreversible representa una medida empírica arbitraria de actividad bajo un conjunto particular de condiciones experimentales que proporciona casi ninguna información sobre el grado de inhibición que puede esperarse bajo cualquier conjunto diferente de condiciones (p. Ej. )

Si está interesado en leer más sobre esta pregunta, tengo una publicación sobre el tema: El resurgimiento de los medicamentos covalentes.

Su premisa es que el sustrato inhibidor se une con una estequiometría 1: 1 a la enzima.

No creo que esta sea una premisa apropiada, ya que las enzimas pueden existir en formas oligoméricas (homo o heterosexuales para nuestras consideraciones) y, por lo tanto, pueden tener múltiples sitios catalíticos activos.

El sustrato inhibidor puede inhibir cooperativamente o no, y las cinéticas de unión se derivan empíricamente, no de forma intuitiva.