¿Cómo puedo determinar todas las OTU en una muestra de kéfir casero?

Un anwer rápido:

  • Extrae el ADN
  • Amplifique regiones específicas de ADN, 16S para bacterias, ITS1 o 2 para levadura
  • Aplicar adaptadores de secuencia
  • Secuencia del ADN
  • Analice los datos, agrupe las secuencias en OTU, intente combinarlas con organismos conocidos de una base de datos
  • Busca las rutas del metabolismo de los organismos

O podría usar espectrometría de masas e ir directamente a la metaproteómica.