¿Cuál es el primer grupo de estudios de seguimiento después del descubrimiento de Watson y Crick?

Probablemente uno de los más importantes fue por Meselson y Stahl. La belleza de su experimento fue que cultivaron bacterias con un medio nutritivo que tenía un pesado isótopo de nitrógeno (Nitrógeno-15), y cuando comenzaron a cultivar la…
¿La microscopía crioelectrónica pronto revolucionará la biología molecular al obviar la necesidad de la cristalografía de rayos X de sustancias difíciles de cristalizar, como los receptores acoplados a proteína G y los canales iónicos?

El santo grial de cualquier proyecto de imagen y reconstrucción con CryoEM es llegar a una estructura con una resolución inferior a 10 Angstroms donde se puedan ver “salchichas” y otras gotas que permitan la colocación de la…
¿Qué es una trama de Ramachandran? ¿Cómo se lee uno y qué información se puede aprender de uno?

Una trama Ramachandran es básicamente una forma de visualizar los ángulos diedros ψ y φ de una cadena principal proteica. Anteriormente expliqué cómo se crea una trama Ramachandran en mi respuesta aquí: Consideremos un simple tripéptido: Las proteínas…
¿Qué es la dispersión rotatoria óptica y el dicroísmo circular? ¿Por qué los usamos?

El dicroísmo circular (CD) es el fenómeno por el cual algunas sustancias absorben desigualmente las polarizaciones circulares izquierda y derecha de la luz. La dispersión rotatoria óptica (ORD) es el fenómeno por el cual la cantidad de rotación…
¿Los factores generales de transcripción son un tipo de factor de transcripción del activador?

Sí, los factores transcripcionales generales (GTF) son una clase de activadores transcripcionales. Esto es muy cierto en el caso de la transcripción eucariota porque los reguladores de la transcripción eucariota controlan la expresión génica a distancia, por lo…
¿La siguiente imagen muestra RVD en un efector TAL?

Sí. Los dos restos representados por las barras son los diresiduos de variable repetida (RVD) en los efectores TAL, y establecen contactos directos con las cadenas de ADN. Los RVD están de hecho flanqueados por hélices en ambas…
¿Cuál es el factor R? ¿Qué dice el valor del factor R sobre una proteína?

Es un término usado en la cristalografía de rayos X como una calidad de ajuste de su modelo atómico a sus datos observados; esencialmente una diferencia porcentual de su modelo en relación con los datos observados. Al decir…
¿Cuál es la convención seguida para numerar los residuos en un GPCR 7TM?

En realidad es un poco complicado. Para 5.38, el 5 sí significa la quinta hélice. Con respecto a los 38, esto se refiere a la posición basada en una convención basada en la alineación de secuencias previamente acordada.…
¿El plegamiento incorrecto de la proteína prión ocurre debido a mutaciones genéticas o se debe al plegamiento normal de proteína y proteína en un conjunto alternativo de condiciones?

Me gustaría compartir la historia de una pareja, Eric Minikel y Sonia Vallabh, en Broad Institute persiguiendo su Ph.D. con nada más que la esperanza de que Sonia de alguna manera se las arregle para esquivar la muerte…
Biología estructural: ¿cuánto “bioquímicos no computacionales” confían en la dinámica molecular?

En general, la mayoría de los biólogos experimentales lo usarán para respaldar una hipótesis si concuerda con algunos datos o ideas que tienen, pero lo ignorarán libremente si no lo hace. El problema no es siempre la educación…