¿Hay alguna inevitabilidad para construir bloques de ADN (especialmente para las partes de base) para adoptar las estructuras exactas como todos sabemos?

Existen otros sistemas posibles y algunos incluso se han hecho experimentalmente. La suposición general es que toda la vida conocida tiene un ancestro común y mantiene en general el mismo sistema.
¿Cómo afectarían las hojas beta a los diagramas de espectroscopía de resonancia magnética nuclear de las proteínas?

Las regiones de hoja beta tienden a mostrar una mayor dispersión de desplazamiento químico que otras regiones. Si observara un espectro HSQC (H / N) de una proteína, vería los picos diseminados más que una proteína que era…
¿Por qué algunas proteínas necesitan formar oligómeros para ser funcionales?

Esta es una excelente pregunta. Los oligómeros de proteínas son abundantes en la naturaleza, y se ha encontrado en varios estudios que solo ~ 25-40% de todas las proteínas en cualquier organismo son monoméricas , mientras que el…
¿Las proteínas con más láminas beta tienen más probabilidades de estar involucradas en la amiloidogénesis?

Sí. Absolutamente. ¡De hecho, se dice que los amiloides están definidos o definidos como estructuras cuaternarias de hojas cruzadas! Recientemente utilicé un programa bioinformático, BETASCAN. Le permite correlacionar múltiples estructuras beta alternativas y abre la posibilidad de investigación…
¿Las personas que utilizan los programas de difracción de rayos X para predecir la estructura de una proteína en función de su patrón de difracción a menudo lo tratan como una caja negra?

A menudo, sí. Por lo general, eso también está bien: el software se ha desarrollado enormemente, y es una historia de éxito de la informática científica el hecho de que algo tan escandalosamente complicado * funciona con los…
¿Cómo el mayor contenido de GC induce una estructura secundaria en ácidos nucleicos?

Me voy a centrar en la estructura secundaria del ADN. Con suerte, alguien más familiarizado con RNA puede escribir una publicación. Primero, una pequeña digresión: Según lo sugerido por Adriana Heguy, las secuencias ricas en GC son más…
¿Se puede usar la difracción de electrones para predecir la estructura de una proteína?

Tal vez, si los cristales son lo suficientemente delgados … La idea se ha revertido durante 20-30 años, pero tradicionalmente se ha limitado a los cristales en 2D. Gonen y compañeros de trabajo en Janelia Farm están presionando…
¿Existen métodos confiables para predecir la posible simetría / simetría de cristalización de las proteínas?

“Lo que ocurre con más frecuencia, ocurrirá más a menudo”. Estadísticamente, la mayoría de las proteínas cristalizarán en una red ortorrómbica. Específicamente en un grupo de espacio P212121. Hasta donde yo sé, no hay forma de predecir la…
Cómo encontrar algunas buenas bases de datos con estructuras primarias de macromoléculas completas y sus subunidades

U puede google, porque no recuerdo el sitio web exacto. Pero Nist base de datos químicos. Base de datos japonesa http://sdbs.db.aist.go.jp/sdbs/c… Puede descargar avagadro, contiene una base de datos decente o puede calcular propiedades Dwsim también le permitirá…
¿Cómo recuerda la gente cómo es una proteína (por ejemplo, el posicionamiento relativo de sus dominios, hélices alfa y hojas beta)?

Soy un bioquímico y un dueño de gato. Entonces puedo encontrar la analogía perfecta. No puedo distinguir gatos de la misma manera que puedo distinguir rostros humanos. Pero incluso en una sala llena de gatos con diseños similares,…