Si quiero estudiar biología estructural, ¿qué cursos adicionales debería tomar si ya soy un especialista en matemáticas?

Sugeriría la física como un tema importante para cualquier persona interesada en la biología estructural y la nanotecnología. La química y la biología también son importantes. Habrá áreas en ambos temas que pueden no parecer relevantes para sus…
¿Qué regiones de la trama de Ramachandran son regiones de bucle?

En primer lugar, para una breve introducción sobre las tramas de Ramachandran, ver: ¿Qué es una trama de Ramachandran? ¿Cómo se lee uno y qué información se puede aprender de uno? Los ángulos diedros para regiones de bucle…
¿En qué se relacionan las coordenadas X, Y, Z en un archivo de base de datos de proteínas (PDB)?

La coordenada XYZ 0,0,0 se encuentra en la esquina de una unidad asimétrica de la red cristalina. Aunque, también es algo arbitrario, y puede ser movido por el usuario.
¿Las hélices alfa involucran un polipéptido, mientras que las hojas plisadas beta involucran a varios?

Las hélices alfa , así como las hojas beta , las disposiciones gamma (globulares) y los dominios menos definidos son partes estructurales de las proteínas plegadas. Tanto las hélices alfa como las láminas beta a menudo consisten en…
¿Qué necesito para ser bueno en la comprensión de la relación función-estructura basada en la publicación de la estructura proteica recientemente resuelta?

Aquí hay una lista parcial de áreas de conocimiento valiosas para analizar críticamente la investigación sobre la relación entre la estructura y la función: 1) principios prácticos de la cristalografía, incluidos los límites prácticos y las trampas. 2)…
¿Qué nos dice una estructura sobre la función de la proteína?

En la bioquímica de proteínas, la estructura cuaternaria se refiere a la capacidad de múltiples unidades independientes más pequeñas para unirse en una estructura proteica más grande. [1] Muchas proteínas de membrana cruzada vienen en unidades múltiples, pero…
¿Cuál es la resolución estructural mínima para simulaciones de dinámica molecular fiables de biomoléculas?

Depende de qué tan confiable y a qué escala quieras ir. Si solo quiere tomar la estructura de rayos X y ejecutar el MD clásico después de algunos pasos de preparación estándar, olvídese de las estructuras con una…
¿Por qué algunos surfactantes como SDS desnaturalizan la proteína pero otros conservan la estructura original de la proteína?

En general, los surfactantes no desnaturalizan las proteínas. De hecho, algunas proteínas en sí mismas actúan como surfactantes. Por ejemplo, algunas proteínas en las bolsas alveolares de los pulmones actúan como surfactantes. Sin embargo, SDS es un detergente…
¿Qué son las proteínas que tienen la misma secuencia pero se llaman diferentes estructuras terciarias? Aparte de priones, ¿algún ejemplo?

Como ya se señaló, estos se llaman isómeros conformacionales. Hay muchos ejemplos además de priones. Los priones y otras proteínas formadoras de fibrillas (como las que causan las enfermedades de Alzheimer y Huntington, entre otros) están mejor caracterizadas…
¿Qué propiedades de la lipoproteína apo-A que la hacen adecuada como proteína andamiaje de membrana (MSP) en nanodisc?

Deben ser anfifílicos para que el lado hidrofóbico pueda estabilizar los lípidos mientras que el lado hidrofílico hace que la proteína sea soluble en agua. Una proteína completamente hidrofóbica se agregará rápidamente y se volverá inútil mientras que…