¿Cómo pudieron los científicos convertir a DsRed, la forma tetramérica de una proteína roja fluorescente, en su forma monomérica (mRed)?

La respuesta completa a esta pregunta está básicamente aquí en este documento de 2002 del laboratorio Tsien: una proteína fluorescente roja monomérica. Aquí hay un resumen: Desventajas de DsRed de origen natural: Maduración lenta e incompleta – Retraso…
¿Cuáles son los mecanismos de acción para varias drogas desestabilizadoras de microtúbulos?

Colcemid (un pariente cercano de la colchicina) actúa uniéndose irreversiblemente a los dímeros de alfa-beta tubulina. Si los dímeros de tubulina están unidos a colcemid, pueden agregarse a un microtúbulo a una concentración mucho más baja que los…
¿Por qué Christian Anfisen eligió la ribonucleasa A para probar la hipótesis termodinámica?

No existen propiedades termodinámicas especiales propias de la RNasa A. Las razones para elegirlo fueron muy prácticas. Lo más importante, fue abundante. De la ribonucleasa Un artículo sobre la Wikipedia: La importancia de la RNasa A pancreática bovina…
¿Cuáles son algunas ideas sobre cómo medir los cambios conformacionales y / o subatómicos en proteínas en tiempo real?

“¿Cuáles son algunas ideas sobre cómo medir la conformación y / o los cambios subatómicos en la proteína en tiempo real?” La forma en que formuló la pregunta me hace pensar que puede estar perdiendo información importante. Los…
¿Cuál es el número mínimo de residuos de aminoácidos en un péptido que se requiere para formar un bolsillo hidrofóbico? ¿Existen buenos sistemas de modelos pequeños para estudiar la formación de tales ambientes hidrofóbicos dentro de la estructura biomolecular?

Depende de lo que quiere decir con “bolsillo”. Pocket implica un sitio de unión estable en la superficie de una proteína. Para los péptidos, que generalmente no tienen estructura terciaria estable, el término “agrupación hidrofóbica” se usa a…
¿KcsA es un canal de potasio dependiente de voltaje?

Se sabe que KcsA está bloqueado por protones (H +). Sin embargo, en 2006 se descubrió que el canal muestra la activación de voltaje independientemente de la activación del protón (activación dependiente del voltaje en el filtro de…
¿Hay algún libro sobre la función de 20 aminoácidos en la proteína?

Los aminoácidos se agrupan en términos de sus químicas de cadena lateral. Algunos son ácidos, básicos o “neutros” en los rangos de pH estándar. Las diferentes combinaciones y secuencias le darán a una proteína diferentes propiedades. La función…
Estoy trabajando con archivos PDB para analizar las estructuras de proteínas. ¿Qué es una buena herramienta o un conjunto de programas para determinar si un archivo PDB está compuesto de homodímeros o heterodímeros?

La respuesta de Akshari Gupta es correcta, sin embargo, si tienes 10s de archivos PDB, no es exactamente el método ideal. Recortar datos de RCSB y escribir un guión Perl / Python funcionaría mejor. Obtener datos de RCSB:…
¿Cómo se usan los términos ‘isotipo’ e ‘isoforma’ cuando se trata de comparar dos secuencias de proteínas de la misma familia?

Una isoforma es una forma de la misma proteína; un isotipo es cualquier proteína de la misma familia de genes. Entonces, todas las isoformas son isotipos, pero no todos los isotipos son isoformas.
¿Cómo se dan cuenta los biólogos de la estructura tridimensional de una proteína?

La estructura 3-d se puede descubrir usando los métodos experimentales tradicionales o mediante el uso de software (en silico) Los métodos tradicionales incluyen: Cristalografía de rayos X NMR microscopio de electrones Las herramientas in-silico incluyen: a través de…