Depende de cómo definas la función, pero generalmente la respuesta es sí.
Por ejemplo, la tripsina y la subtilisina son serina proteasas que usan la misma geometría de la tríada catalítica, pero por lo demás son estructuralmente completamente diferentes.
Otro ejemplo son los factores de transcripción: hay muchas, muchas formas de construir un represor contra un objetivo similar. Para reprimir un gen procariótico, una proteína solo necesita sentarse cerca del promotor para que el promotor esté ocluido. Hay una gran variedad de diferentes arquitecturas represoras procariotas para lograr esto.
De forma similar, muchos experimentos muestran que los activadores eucariotas pueden tener una arquitectura muy similar: básicamente, solo traen la polimerasa cerca del promotor. Esta es la base del sistema de dos híbridos de levadura para detectar interacciones proteína-proteína. Como era de esperar, hay muchas familias de proteínas de factores de transcripción eucariotas.
Muchas, muchas funciones muestran esta propiedad que la naturaleza ha resuelto el problema muchas veces con soluciones estructuralmente diferentes. Transportadores, canales iónicos, hidrolasas, etc., etc.
Muchos argumentos creacionistas se basan en la falacia de que solo hay una solución posible para un problema biológico; a menudo hay muchos, especialmente si la “función” se define de manera abstracta.
