En una palabra: Probablemente.
Si una enzima adecuada no existe actualmente, no hay una razón obvia por la que no se pueda diseñar una ingeniería para que tenga al menos * alguna * actividad en la anfetamina. Según wiki, existe una enzima llamada “amina n-metiltransferasa”:
http://en.wikipedia.org/wiki/Ami…
Si tuviera que adivinar, asumiría que también funcionaría con la anfetamina, ya que parece ser estructuralmente similar a la triptamina (que la enzima está documentada para metilar).