La premisa básica de la ultracentrifugación es que las partículas sedimentarán a diferentes velocidades en función de parámetros como la viscosidad del medio, el tamaño de la partícula y su masa. Esto generalmente se puede describir mediante la ecuación de Svedberg 
Ultracentrifugación y la ecuación de Svedberg
Como se muestra en la ecuación, si la densidad de la partícula coincide con la densidad del medio, la partícula detendrá la migración. Por lo tanto, en una centrifugación en gradiente, los diversos liposomas se separarán por densidad.
Para un liposoma vacío, el liposoma esencialmente contiene agua y tendrá una densidad menor. Sin embargo, si ha encapsulado un fármaco, la densidad de la partícula es ahora mayor y, de acuerdo con la ecuación, tendrá un mayor coeficiente de sedimentación y se moverá más durante la centrifugación. Tras la recogida de las fracciones, se puede medir la concentración de liposomas o fármacos para determinar la eficacia de encapsulación.
