Las micromatrices de expresión genética de Affymetrix son la tecnología más probada para la expresión génica en la clínica: se han descubierto biomarcadores de expresión más putativos con Affymetrix y validados científicamente con más de 20,000 publicaciones. http://www.affymetrix.com/public…
Además Affymetrix tiene la única plataforma de expresión genética aprobada por la FDA, así como las pruebas aprobadas por la FDA de socios como Pathwork Diagnostics http://www.pathworkdx.com
NanoString es una nueva tecnología muy prometedora para observar la expresión génica en un panel de genes (hasta 800 actualmente). A diferencia de otras tecnologías, no hay amplificación, por lo que la señal que está viendo son recuentos de genes en bruto.
Puede obtener más información sobre la versión clínica de su sistema en su sitio web:
nCounter® Dx Analysis System
Microarrays ya están esencialmente muertos en el entorno de investigación. Han existido por mucho tiempo, por lo que hay muchas pruebas clínicas disponibles. Sin embargo, es una tecnología envejecida en su camino de salida.
Más información sobre el diseño de su experimento o puntos finales de investigación sería útil saber. No estoy seguro de qué diferencia el estudio de la expresión génica en un entorno clínico de cualquier otro entorno de investigación, pero de todos modos ofreceré una herramienta de software para el análisis de datos de expresión génica basada en microarrays: Agilent GeneSpring GX ( http: //www.genomics.agilent .com / …).
Es mucho más fácil de operar que las herramientas de código abierto porque tiene una GUI y flujos de trabajo guiados para análisis comunes, que lo hacen una buena opción para las personas que son menos conocedoras de la bioinformática, sin embargo, entienden la bioestadística.
