La similitud y la identidad son dos cosas diferentes. La similitud significa tener residuos iguales o similares en una alineación. Si la secuencia A tiene una tirosina mientras que B tiene una fenilalanina en la misma posición, son similares y, por lo tanto, contribuyen a la puntuación de similitud. Pero la identidad significa que los residuos en una posición determinada deben ser idénticos. Habiendo dicho eso, debes buscar la identidad junto con la similitud. > 25% de identidad es lo suficientemente decente como para hacer una comparación.
¿El 40% es una similitud de residuos alta para las proteínas que pertenecen a la misma clase?
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