En primer lugar, todos los aminoácidos individuales (AA) son polares ya que, en soluciones acuosas a pH fisiológico, existen como “zwitteriones”, con grupos cargados en “extremo”: un NH3 + en el “extremo N terminal” y un CO2- en el extremo C Las moléculas cargadas ciertamente exhiben polaridad.
Sin embargo, creo que lo que realmente está preguntando es acerca de los ~ 20 “grupos R” canónicos o cadenas laterales que distinguen químicamente a cada AA como único. Entonces, ¿cómo se puede saber si un grupo R es polar?
La forma más fácil es consultar un cuadro como este:
Pero la mejor manera es tener una idea de lo que significa “polaridad” y ser capaz de identificar las características de las moléculas orgánicas polares o grupos funcionales.
Aquí hay una cartilla fácil sobre polaridad molecular: polaridad química
¿Puede el glifosato sustituir al aminoácido glicina?
¿Puede una secuencia de ADN de proteínas ser determinada por los aminoácidos en la proteína?
Hay aminoácidos alifáticos con 1, 3 o 4 átomos de carbono en la cadena lateral, pero no 2. ¿Por qué?
En el cuadro anterior, puede ver que todos los AA “POLAR” terminan con OH, SH o carbono carbonilo + NH2 (vea Asn y Gln). Estos AA polares (por definición son hidrofílicos, como lo son los ácidos y básicos, mientras que todos los AA no polares son hidrófobos, por lo tanto “les gusta estar ubicados lejos del medio acuoso de la célula y afectar el plegamiento en consecuencia”.