Cómo saber si un aminoácido es polar o no polar

En primer lugar, todos los aminoácidos individuales (AA) son polares ya que, en soluciones acuosas a pH fisiológico, existen como “zwitteriones”, con grupos cargados en “extremo”: un NH3 + en el “extremo N terminal” y un CO2- en el extremo C Las moléculas cargadas ciertamente exhiben polaridad.

Sin embargo, creo que lo que realmente está preguntando es acerca de los ~ 20 “grupos R” canónicos o cadenas laterales que distinguen químicamente a cada AA como único. Entonces, ¿cómo se puede saber si un grupo R es polar?

La forma más fácil es consultar un cuadro como este:

Pero la mejor manera es tener una idea de lo que significa “polaridad” y ser capaz de identificar las características de las moléculas orgánicas polares o grupos funcionales.

Aquí hay una cartilla fácil sobre polaridad molecular: polaridad química

En el cuadro anterior, puede ver que todos los AA “POLAR” terminan con OH, SH o carbono carbonilo + NH2 (vea Asn y Gln). Estos AA polares (por definición son hidrofílicos, como lo son los ácidos y básicos, mientras que todos los AA no polares son hidrófobos, por lo tanto “les gusta estar ubicados lejos del medio acuoso de la célula y afectar el plegamiento en consecuencia”.

Para un biólogo, usted puede prácticamente salirse con la siguiente ecuación: O> N> C = H. Esto describe la electronegatividad, o “codicia” que tienen los diferentes átomos para los electrones. Cuanto más codiciosos son, más difícil es “jalar” de los electrones compartidos. Si uno está tirando más fuerte que el otro, los electrones pasan más tiempo con ese átomo, y dado que obtiene una mayor proporción de electrones de lo que “se merece”, es parcialmente negativo. El átomo perdedor es parcialmente positivo. Así es como terminas con términos como enlace covalente polar y no polar. Covalente significa que comparten electrones, ¡polar o no polar te dice lo bien que los están compartiendo!

Fuimos dos átomos de electronegatividad igual Compartimos electrones, ellos comparten justo y cuadrado – lo que significa que no se acumula ninguna carga parcial.

Si bien esto no te dirá si un átomo dado logra una carga completa, o solo una carga parcial, es suficiente para hacerte saber si hay átomos en una cadena lateral con cargas parciales … Lo que significa que la cadena lateral tiene elementos polares. Si no hay cargas parciales, es un aminoácido no polar.

Los aminoácidos polares son los que están cargados (positivamente: lisina, arginina, histidina o negativamente: aspartato, glutamato) y contienen un grupo hidroxilo (-OH) o amida en la cadena lateral. Otra molécula polar es la molécula de cisteína que contiene azufre.

Los aminoácidos no polares son el resto.

Basado en soluble en agua e insoluble en agua, se puede diferenciar entre una molécula polar y una no polar. Lo mismo ocurre con los aminoácidos.

¿Están los hidrógenos organizados en simetría alrededor del moity 3D? Si es así, como un anillo de benceno, entonces no es polar, ya que todas las cargas se distribuyen por igual. Con los aminoácidos, estos elementos anexos les dan sus características, como la ploaridad, la carga y el punto isoeléctrico.

Diferentes electronegatividades del grupo amino y el ácido carboxílico (o amonio y carboxilato en forma de zwitterión) darán como resultado una molécula polar.