Las bases nitrogenadas se nombran como tales debido a la naturaleza básica de los grupos funcionales de nitrógeno que poseen.
La estructura del amoníaco (NH3) muestra que el nitrógeno tiene un par de electrones en la parte superior, lo que hace que ese extremo de la molécula sea más negativo. El nitrógeno es por lo tanto capaz de atraer un ion de hidrógeno positivo (H +) hacia sí mismo para formar un ion de amonio (NH4 +).
Un aceptor de protones (H +) es una definición de base.
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