Añadiendo a los puntos que Sai mencionó:
- Estructura terciaria: con un poco de práctica, puede identificar los principales tipos de pliegues que se encuentran comúnmente en las proteínas. Los más fáciles de detectar son paquetes de hélice o barriles beta, pero depende del tipo de proteínas con las que trabaje. Tengo muchas hélices beta en mis proteínas, y estoy particularmente contento cuando veo otras proteínas que las contienen.
- Conjuntos macromoleculares: puede usar PyMol para reconstruir un complejo simétrico para evaluar la estructura general de un ensamblaje oligomérico grande, por ejemplo, cápsides virales o microtúbulos.
- Interfaces de interacción biomolecular: a menudo necesitas saber qué residuos de tu proteína interactúan con pequeñas biomoléculas u otras proteínas. Si está buscando complejos, puede que necesite saber cómo las proteínas respectivas son diferentes individualmente y dentro del complejo.
- “Doblaje” de la proteína: si colorea la proteína con factores beta, puede juzgar qué partes de la proteína son compactas y qué partes son flexibles / flojas.
