Cristalografía de rayos X: una proteína homóloga que comparte similitud de secuencia con la proteína diana presumiblemente tendrá una estructura similar. Si la proteína está lo suficientemente cerca en secuencia a la proteína diana, las fases conocidas de la primera estructura cristalina se pueden usar para resolver las fases del cristal de la proteína desconocida mediante un proceso llamado reemplazo molecular. (1) Alrededor del 70% de las estructuras cristalinas de las proteínas se resuelven de esta manera. Lo suficientemente cerca en este caso significa ~ 35% de identidad de secuencia diseminada para cubrir al menos el 50% de la estructura (2)
RMN: No es tan útil. Si se resuelven suficientes picos y se obtienen suficientes restricciones de distancia, la estructura se puede resolver sin ninguna información adicional. Si los tramos de la secuencia tienen una estructura casi idéntica y una secuencia casi idéntica a la de una estructura de RMN resuelta, pueden ser útiles, si no necesariamente esenciales, para la asignación de los picos.
1. http://www.bioinfo.rpi.edu/bystr…
2. Reemplazo molecular: trucos y golosinas http://journals.iucr.org/d/issue…
