Similar a la respuesta del usuario de Quora, pero para un enfoque de mayor rendimiento, querrás hacer selecciones, no pantallas.
Con las pantallas fluorescentes está limitado a quizás más de 1000 muestras, mientras que con las selecciones en bacterias puede escalar hasta 10 ^ 8 muestras.
Entonces, cómo funciona la prueba de interacción proteína-proteína FLI-TRAP es que algunos investigadores dividen el gen de la beta-lactamasa (resistencia a la ampicilina) en dos mitades. La mitad es la secuencia de señal, la región N-terminal que le dice a la bacteria que exporte el polipéptido al periplasma; la otra mitad es la proteína bla madura.
Luego puede fusionar sus dos interactores potenciales con la secuencia de señal y la proteína bla madura. Si interactúan, la secuencia de señal ahora se asocia de forma no covalente con la proteína bla, y la proteína bla se exporta al periplasma, lo que confiere resistencia a la ampicilina. Si no hay interacción, entonces la proteína bla no se elimina y no hay resistencia a la ampicilina.
Este enfoque es muy similar al del doble híbrido de levadura, pero puede haber algunas ventajas inherentes, ya que la asociación debe pasar el mecanismo de control de calidad de exportación tat. Por lo tanto, aunque los sistemas Y2H y B2H sufren altos falsos positivos debido a la activación transcripcional aleatoria, el sistema FLI-TRAP selecciona interacciones fuertes (1nm) bastante bien sobre interacciones débiles (1microM).
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