En primer lugar, necesitaría saber si es un homo-oligómero u heterooligómero, donde el sitio activo es (específicamente, los dominios transmembrana y citosólico necesarios para la función), y qué exactamente sobre eso le gustaría estudiar. .
Un método de bajo rendimiento implicaría el uso de detergentes para romper la membrana plasmática en las células que se han inducido a crear la proteína. Luego puede purificar la proteína por cualquier cantidad de métodos, con la esperanza de que el complejo proteico permanezca intacto sin estar unido a la membrana.
Otro método es hacer que el complejo sea soluble. Esto requiere la adición de una secuencia señal al extremo N (o terminal si es hetero oligomérico), así como (lo más probable) la eliminación de los dominios transmembrana y citosólico (dependiendo, de nuevo, de las proteínas). Usualmente, después de la eliminación de estos dominios, una proteína no mantendrá su estructura nativa sin la introducción de mutaciones para promover la asociación intermolecular, o un motivo de estabilización heterólogo (como el motivo T4 Fibritin Foldon para proteínas triméricas).