¿Qué es la heterogeneidad mutacional?

Gracias por agregar el enlace al documento: ¡ese contexto cambia mi respuesta!

Originalmente pensé que se refería a la heterogeneidad mutacional en el sentido de que las células de un tumor no son todas iguales: están presentes diferentes mutaciones en diferentes células. Esta es la definición que escucho con más frecuencia.

Sin embargo, el documento con el que se vinculó afirma que están estudiando la “heterogeneidad en las tasas de mutación” y que observan “variaciones en la frecuencia y el espectro de las mutaciones dentro de los tipos de cáncer”. Este es un concepto diferente que se refiere a las comparaciones entre diferentes tumores, en lugar de diferentes células dentro del mismo tumor.

La idea aquí es que habrá números y tipos de mutaciones muy diferentes en diferentes tumores. Los autores encontraron que algunos cánceres tienen muy pocas mutaciones, mientras que otros tienen cientos de ellos, y que el número varía ampliamente, incluso en tumores del mismo tipo.

También encontraron diferentes tipos de mutaciones en diferentes tipos de tumores. Por ejemplo, en cánceres de pulmón encontraron más mutaciones donde una base C se convirtió en una base A (que es una firma conocida de daño causado por algunos de los químicos en el humo del cigarrillo); en contraste, los melanomas contenían más mutaciones donde una base C se convertía en una base T (que es una firma conocida de daño causado por la luz ultravioleta).

¿Porque es esto importante? Se trata de saber qué buscar cuando se secuencia el genoma de un nuevo tumor. Estos hallazgos muestran que no se puede suponer que habrá un número “promedio” de mutaciones, o que el tipo de mutaciones será el mismo en todos los tipos de cáncer (ya lo sospechamos en cierta medida, pero no fue así). ha sido sistemáticamente analizado de esta manera antes). Esto afecta los tipos de estadísticas que deben ejecutarse en los datos de secuenciación (no estoy seguro exactamente cómo, porque no soy un estadístico, pero sé que puede ajustar sus parámetros para cambiar el umbral en el que puede decir que confías en que has visto una mutación en una posición particular).

En pocas palabras, las colonias celulares que componen un tumor no son homogéneas. Exhiben un comportamiento evolutivo a lo largo del tiempo. Esto permite que las células tumorales obtengan la funcionalidad necesaria para la progresión de la enfermedad. Por ejemplo, tendemos a ver que algunas células pierden la adhesión celular lo que les permite separarse del tumor primario. Algunas células ganarán la capacidad de intravasate, migrar y extravasate (entrar, viajar y salir de la vasculatura) necesario para la metástasis.

Si está tomando muestras de un tumor en un intento de determinar los cambios genéticos que están causando la enfermedad, sus respuestas pueden variar según las partes del tumor que perforó para tomar la muestra, y en qué etapa estaba el paciente cuando las muestras eran tomado.