¿Cómo sintetizamos una proteína químicamente?

La manera fácil:

Inserte un gen que codifica la proteína deseada en el genoma de E. Coli y pídales que hagan el trabajo por usted. Pero como no soy biólogo, te presento:

La (imposiblemente) dura manera:

Los aminoácidos que componen las proteínas se pueden unir mediante una reacción de amidificación, que formaría enlaces peptídicos. Ahora, si solo lanzamos glicina y prolina juntos, tenemos cuatro posibles productos:

1. Glicina-glicina
2. Glicina-prolina
3. Prolina-glicina
4. Proline-prolina

La forma de evitar esto es instalar un grupo protector en un extremo de cada uno de los aminoácidos que estamos reaccionando. Esto hace que los grupos protegidos no sean reactivos, por lo que solo pueden reaccionar el COOH (ácido carboxílico) y NH2 (amina) sin protección.

Digamos que queríamos hacer un tripéptido, Val-Gly-Asp. Primero protegeríamos el COOH de la valina y el NH2 de la glicina y luego ejecutaremos la reacción de amidificación. Luego, eliminaríamos el grupo protector de la glicina y protegeríamos los dos grupos COOH de aspartato (recuérdese que su cadena lateral termina en un ácido carboxílico). El extremo C del dipéptido Val-Gly todavía está protegido del paso anterior, por lo que no tiene que preocuparse por esto aquí. Ejecute la amidificación nuevamente y elimine los grupos protectores restantes.

Puedes imaginar que este sería un proceso muy arduo, especialmente para una proteína que tiene cientos de aminoácidos de longitud. Eso ni siquiera explica el hecho de que perderías producto con cada paso (el último documento que vi esbozando una reacción de amidificación reportó rendimientos de entre 40% y 95%, ahora imagina ejecutarlo cien veces). Además, puedo imaginarme problemas si la amidificación implicaba la adición a un aminoácido no polar, ya que se enterraría en la proteína y llegaría a ser algo inaccesible para los grupos entrantes, especialmente los polares.

En resumen, me quedaría con la manera fácil. Aunque no soy biólogo.