¿Las proteínas solo se conectan con otras usando un enlace de hidrógeno de “amino” y “ácido”? ¿También se conectan con la ‘R’? Además, ¿las proteínas solo se conectan con las del mismo valor ‘R’?

El enlace de hidrógeno del que hablas ocurre en la generación de hélices alfa y hojas beta.

Casi cualquier otra acción que puedas imaginar también ocurre en proteínas: enlaces de hidrógeno entre grupos R, enlaces de hidrógeno entre el grupo R y el grupo amino o carboxi de la estructura, interacciones hidrofóbicas entre cadenas laterales, interacciones carga-carga entre cadenas laterales (mira lisina, que es positiva, y glutamato, que es negativo).

Atlas de interacciones de cadena lateral de proteínas
(Tuve que cargar este sitio dos veces para que funcione, pero es una lista intensa, ¡así que quizás valga la pena!)

Incluso hay interacciones covalentes; dos cisteínas pueden formar un enlace covalente conocido como enlace “disulfuro” porque se forma entre los sulfuros de cada uno.

Las conexiones se forman entre los grupos R complementarios (o partes complementarias): donadores de enlaces de hidrógeno a los receptores; dos regiones hidrofóbicas de contacto para excluir el agua; las cargas positivas se ’emparejan’ con las cargas negativas.

Lo que hace que descubrir la estructura de las proteínas sea difícil es el NÚMERO de posibles interacciones favorables, así como el factor de complicación que puede tener la opción de tocar agua en vez de competir entre sí y regar … la estructura que formas tiene la mayor interacción positiva en general … y esto puede ser solo un poco mejor que el segundo mejor, que sin embargo puede ser poco común. ¡Por eso el juego funciona!

El grupo amino y el grupo carboxílico forman enlaces amida (NHCO) entre aminoácidos. La permutación de aminoácidos en una proteína se llama estructura primaria. Los enlaces de amida no son enlaces de hidrógeno sino enlaces covalentes.

Sí, los grupos R pueden interactuar entre sí para formar una variedad de enlaces que determina las estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias de las proteínas. Los grupos R con grupos hidroxi y amino pueden formar enlaces de hidrógeno. Los grupos R que contienen azufre pueden formar enlaces disulfuro. Los grupos carboxilo y amino pueden formar enlaces iónicos entre sí. Los grupos R no tienen que ser lo mismo para unirse .

-Gt. Yuhan Zhang (estudiante de biología de A-nivel orgulloso)

Algunos grupos ‘R’ pueden formar enlaces, pensar en grupos ácidos y básicos, y el azufre puede formar enlaces fuertes con sulfuros de otras partes. Pero en su mayor parte, la unión primaria es el amino con ácido carboxílico. Los enlaces aminocarboxilo forman la estructura primaria de una proteína (su secuencia), cualquier otro enlace hace que el secundario (partes de la estructura rudimentaria como hélices y láminas), terciario (mayor conformación de la parte proteica) y posiblemente incluso cuaternario (agrupamiento / unión de estructuras de múltiples subgrupos).

La columna vertebral de todas las proteínas está formada por enlaces peptídicos covalentes entre los grupos amino y ácido carboxílico, sin duda. Pero eso solo te deja con una cadena floja de aminoácidos. El verdadero trabajo de hacer una proteína funcional ocurre a través de los enlaces no covalentes entre las cadenas laterales (el grupo “R” que mencionas), así como el enlace covalente entre dos átomos de azufre en la cadena lateral de la cisteína.