Hay tres aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas a pH neutro. Estos son arginina (Arg), lisina (Lys) e histidina (His). Sus cadenas laterales contienen nitrógeno y se parecen al amoníaco, que es una base. Sus pKa son lo suficientemente altos que tienden a unir protones, ganando una carga positiva en el proceso.
Lisina:
Los aminoácidos se nombran así porque tienen un grupo amino, NH3 +, en un extremo de la cadena principal, y un grupo ácido carboxílico, COO-, en el otro extremo. Puedes pensar en estos como NH2 y COOH, pero a pH fisiológico se les cobra. Exceptuando la presencia de otros grupos cargados, los aminoácidos son neutros.
Sin embargo, si se presenta otro grupo amina en la cadena lateral, como con la lisina, ese grupo lateral también puede cargarse a pH fisiológico, lo que resulta en una carga positiva adicional y una carga total de +1 en el aminoácido. Lo contrario es cierto para las cadenas laterales ácidas, como el aspartato (-1 carga global).
Cuando un ácido dona un protón, se conoce como la base conjugada de la molécula original y debe experimentar un cambio en la carga total de -1. No te preocupes demasiado por H3O y OH, solo es una forma útil de pensarlo, pero no siempre es válido.