¿Cómo funciona la lisina, que es un aminoácido básico con fórmula strutural: (CHCOO- (NH3 +) CH2CH2CH2CH2NH3 +) tiene una carga positiva. ¿No se supone que los ácidos son positivos porque pueden desprotonarse más fácilmente?

Hay tres aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas a pH neutro. Estos son arginina (Arg), lisina (Lys) e histidina (His). Sus cadenas laterales contienen nitrógeno y se parecen al amoníaco, que es una base. Sus pKa son lo suficientemente altos que tienden a unir protones, ganando una carga positiva en el proceso.

Lisina:

Los aminoácidos se nombran así porque tienen un grupo amino, NH3 +, en un extremo de la cadena principal, y un grupo ácido carboxílico, COO-, en el otro extremo. Puedes pensar en estos como NH2 y COOH, pero a pH fisiológico se les cobra. Exceptuando la presencia de otros grupos cargados, los aminoácidos son neutros.

Sin embargo, si se presenta otro grupo amina en la cadena lateral, como con la lisina, ese grupo lateral también puede cargarse a pH fisiológico, lo que resulta en una carga positiva adicional y una carga total de +1 en el aminoácido. Lo contrario es cierto para las cadenas laterales ácidas, como el aspartato (-1 carga global).

Cuando un ácido dona un protón, se conoce como la base conjugada de la molécula original y debe experimentar un cambio en la carga total de -1. No te preocupes demasiado por H3O y OH, solo es una forma útil de pensarlo, pero no siempre es válido.

La forma en que construiste tu pregunta realmente muestra que estás muy confundido.

¿La respuesta de Giang Lê a qué aminoácido es más polar, valina o lisina? ¿Por qué?

La respuesta de Giang Lê a ¿Cuáles son algunas de las características de los aminoácidos?

  1. Los aminoácidos se llaman aminoácidos por tener el grupo carboxílico. Sí, está desprotonado. Pero este grupo no hace nada al cargo general. Está unido con el siguiente aminoácido a través del enlace dipéptido; o cancelado por el N-terminal en el otro lado de la cadena.
  2. Una cadena lateral se denomina básica porque tiene un grupo básico (en el caso de la lisina, una amina primaria NH2). Incluso lo llamaste “aminoácido básico” (no sé cómo suena raro, pero muchos científicos lo llaman así de todos modos, así que lo que sea, lo que prefiero es “cargar positivamente”). Esta cadena lateral es lo que contribuye a la carga global.
  3. Ver la respuesta de Giang Lê a qué aminoácido es más polar, valina o lisina? ¿Por qué?
  4. Los ácidos se “desprotonan fácilmente”. Esto es completamente diferente a “desprotonarse más fácilmente”.
  5. Intente comprender el conocimiento básico primero antes de llegar a este nivel. Esta pregunta en serio suena como si alguien tratara de adelantarse a sí mismo.

Los ácidos tienen un protón que se complacen en dar a grupos más básicos como las aminas, que convierten el ácido en un grupo carboxilato cargado negativamente (ha perdido una carga positiva al donarlo) y la amina en una sal de amonio con carga positiva.

La lisina tendrá una carga positiva en el nitrógeno de la cadena lateral en condiciones ácidas, pero en la solución básica, será neutral, por lo que su carga depende de su entorno.