¿Por qué hay solo 20 aminoácidos naturales?

¿Por qué solo 20 se encuentran en las proteínas?

Pensemos en la maquinaria que lee el código genético y agrega el aminoácido correcto en el lugar correcto en una proteína.

Esa maquinaria solo puede hacer frente al código, que tiene 2 o 3 bases de largo.

Eso limita la cantidad de aminoácidos diferentes que puede administrar, entre 16 y 64.

2 código base … tiene 16 combinaciones aa ag ac en ca cc cg ct ga gc gg gt ta tc tg tt.

Código base 3, es 64.

Todas las formas de vida usan la misma maquinaria.

El código de ADN está en grupos de 3 bases.

Pero a menudo la maquinaria solo lee los primeros 2, e ignora la 3ra base, o no parece importarle mucho lo que es.

Y en millones de años de evolución … la naturaleza no ha superado ese límite.

Así que mi opinión es que tenemos solo 20 aminoácidos en proteínas, porque la maquinaria de fabricación de proteínas solo puede distinguir con precisión, sobre esa cantidad de códigos.

También a la naturaleza le gusta ser redundante … tiene varias formas de hacer lo mismo. Entonces, si 1 vía falla, hay otras listas para asumir el control.

Si dijimos 64 aminoácidos esenciales … y el sistema para 1 de ellos falla … no retrocedamos.

Pero si tienes 20 aminoácidos, hay 3 sistemas para cada uno. Uno falla, hay otros 2 similares, que podrían hacerse cargo.

De todos modos … estoy interesado en especular.

La selenocisteína y la pirrolisina (que se encuentra en las proteínas normales) ahora están llorando en la esquina. Junto con algunos D-aminoácidos de ciertas bacterias (que sus proteínas no se degradarán fácilmente) …

Aunque sí, un código genético codifica solo 20aa, definitivamente hay más, incluidas modificaciones químicas estándar, y un intercambio S-Se más exótico, etc.

Si tuviera que mirar desde una perspectiva química en cada uno de los aminoácidos y caracterizar sus cadenas laterales, casi todo está allí. Tiene aminoácidos polares, no polares, con carga positiva, cargados negativamente, aromáticos, voluminosos, rígidos, flexibles, simétricos y asimétricos. Es un conjunto de herramientas diversas que nuestras células pueden usar para construir casi cualquier cosa necesaria. Todo lo que no se puede hacer con 20 aminoácidos se soluciona modificando la estructura original o añadiendo carbohidratos, lípidos o incluso metales.

Falso. Hay cientos de aminoácidos que ocurren naturalmente.

Los aminoácidos son moléculas en las que un carbono (llamado carbono alfa) se une simultáneamente a un grupo amino y un grupo ácido carboxílico.

Sin embargo, es cierto que solo Nature utiliza 20 aminoácidos para producir proteínas (bueno, 22, pero los 2 extra-selenocisteína y pryyolisina) se utilizan con mucha menos frecuencia que los demás).

Hay más de 300 aminoácidos presentes en la naturaleza, pero solo 20 aminoácidos L-alfa comúnmente constituyen las proteínas humanas y estos aminoácidos se llaman aminoácidos estándar o aminoácidos proteogénicos.

Los L-alfa-aminoácidos se unen covalentemente a través de enlaces peptídicos para formar proteína. Se forma un enlace peptídico entre el grupo alfa-carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el grupo alfa-amino (-NH2) del aminoácido adyacente. En una cadena polipeptídica, el grupo alfa-amino libre (-NH2) y el grupo alfa-carboxilo (-COOH) de los aminoácidos terminales se denominan N-terminal y C-terminal, respectivamente.

Nuestro ADN solo codifica 20 aminoácidos en 64 codones.

En realidad, hay más de 100 aminoácidos diferentes en la naturaleza, pero la mayoría de los eucariotas y procariotas usan 20 de ellos. Los humanos usan esos 20 y hacen selenociteína de uno de los 20

Solo se necesitan alrededor de 20 en la vida, pero hay miles de aminoácidos diferentes.