Las proteínas están formadas por largas cadenas de aminoácidos. Las cadenas cortas están considerando polipéptidos, y una cadena que consta de solo dos aminoácidos sería un dipéptido.
No existe una línea clara universalmente aceptada entre “polipéptido” y “proteína”, y las cadenas cortas (por ejemplo, alrededor de 30 aminoácidos) pueden ser referidas como polipéptidos por algunos y proteínas por otros. Esto a menudo se relaciona con el tema, más que con cualquier definición estricta de los usuarios. Por ejemplo, al digerir una proteína completa, los fragmentos más pequeños resultantes se denominan típicamente polipéptidos, no proteínas, independientemente de la longitud. Sin embargo, la insulina madura, a 51 aminoácidos, a menudo se denomina indistintamente un polipéptido y una proteína. (En sentido estricto, la insulina madura contiene dos cadenas polipeptídicas unidas).
