El tipo más común de daño de proteína por ROS es la oxidación de los grupos Fe-S. La oxidación de los clústeres de Fe-S hace que se disocien de la proteína. Como los agregados de Fe-S son esenciales para el correcto funcionamiento de algunas proteínas, su oxidación las dejaría inactivas.
Además, el H2O2 puede oxidar directamente el hierro asociado con las enzimas mononucleares, lo que da como resultado la formación de más radicales libres de oxígeno en las proximidades de la molécula. Esto podría oxidar irreversiblemente los aminoácidos en las proximidades del sitio de unión a Fe, haciendo que la proteína sea inactiva.
