Depende de los detalles de tu experimento. El intercambio de hidrógeno generalmente se mide a través de un experimento de pulso-persecución donde la proteína se etiqueta en el medio D20 durante un período de tiempo específico antes de cambiarlo al medio sin etiqueta para la medición. El grado de intercambio dependerá de la tasa de cambio y la duración del período de pulso.
En general, sin embargo, los hidrógenos enterrados en el medio de la membrana se intercambian muy lentamente, alrededor de 100.000 veces más lentamente que en una proteína soluble desplegada. [1] Eres bastante seguro al suponer 0% para este parámetro a menos que la proteína se empape en D20 durante semanas antes de la medición.
Notas a pie de página
[1] Cinética de intercambio de hidrógeno en una proteína de membrana determinada por espectroscopía NMR de nitrógeno-15: uso del experimento INEPT para seguir amidas individuales en la proteína de la cubierta M13 solubilizada con detergente – Bioquímica (Publicaciones de ACS)
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