¿Qué tan significativo es el apilamiento de bases en la formación y mantenimiento del ADN bicatenario?

He leído mucho sobre la capacidad de apilamiento de bases para estabilizar el ADN de ds y cómo son más importantes que los enlaces de hidrógeno. Por lo tanto, intentaré responder a la segunda parte de su pregunta,…
¿Cómo pudieron los científicos convertir a DsRed, la forma tetramérica de una proteína roja fluorescente, en su forma monomérica (mRed)?

La respuesta completa a esta pregunta está básicamente aquí en este documento de 2002 del laboratorio Tsien: una proteína fluorescente roja monomérica. Aquí hay un resumen: Desventajas de DsRed de origen natural: Maduración lenta e incompleta – Retraso…
Bioquímica: ¿Cuándo se convertirán las enzimas construidas a medida en algo común?

Eso depende de cómo definas el lugar común; hay varios enzimas diseñadas racionalmente en uso ya. Por ejemplo, muchos detergentes usan una lipasa modificada diseñada para mantenerse activa a pesar de la presencia de jabones y agua caliente.…
¿Por qué Christian Anfisen eligió la ribonucleasa A para probar la hipótesis termodinámica?

No existen propiedades termodinámicas especiales propias de la RNasa A. Las razones para elegirlo fueron muy prácticas. Lo más importante, fue abundante. De la ribonucleasa Un artículo sobre la Wikipedia: La importancia de la RNasa A pancreática bovina…
¿Cuáles son algunas ideas sobre cómo medir los cambios conformacionales y / o subatómicos en proteínas en tiempo real?

“¿Cuáles son algunas ideas sobre cómo medir la conformación y / o los cambios subatómicos en la proteína en tiempo real?” La forma en que formuló la pregunta me hace pensar que puede estar perdiendo información importante. Los…
¿Cuál es el número mínimo de residuos de aminoácidos en un péptido que se requiere para formar un bolsillo hidrofóbico? ¿Existen buenos sistemas de modelos pequeños para estudiar la formación de tales ambientes hidrofóbicos dentro de la estructura biomolecular?

Depende de lo que quiere decir con “bolsillo”. Pocket implica un sitio de unión estable en la superficie de una proteína. Para los péptidos, que generalmente no tienen estructura terciaria estable, el término “agrupación hidrofóbica” se usa a…
¿KcsA es un canal de potasio dependiente de voltaje?

Se sabe que KcsA está bloqueado por protones (H +). Sin embargo, en 2006 se descubrió que el canal muestra la activación de voltaje independientemente de la activación del protón (activación dependiente del voltaje en el filtro de…
¿Cuáles son algunos artículos fundamentales sobre el plegamiento de proteínas?

El tema ha evolucionado constantemente en las últimas décadas. Algunos de los clásicos son por: – Anfinson – Tanford – Schmid – Eneldo – Creighton Las siguientes reseñas son sobresalientes por lo que escuché. Todavía los estoy buscando:…
¿Por qué el plegamiento de proteínas es un problema importante? ¿Cuáles son sus aplicaciones?

He pasado una buena parte de mi tiempo pensando en esta pregunta. Debo admitir que ha habido días en los que he sentido que estamos exagerando el “problema de plegamiento de proteínas”. Sin embargo, a lo largo de…
¿Qué es la biofísica de membrana y por qué es importante?

Los lípidos son una parte esencial de las membranas celulares. Forman la columna vertebral al igual que los enlaces fosfodiéster y el azúcar para el ADN. Las tres clases principales de lípidos de membrana son fosfolípidos, glucolípidos y…