¿Cuál es el efecto de la “aglomeración molecular” en el plegamiento de proteínas in vivo?

¿Qué es exactamente el hacinamiento molecular? La mayoría de los experimentos bioquímicos estudian el plegamiento en soluciones tampón. Sin embargo, el entorno intracelular está lleno de macromoléculas, por lo que existe una cierta cantidad de espacio intracelular que…
Hablando en términos generales, ¿qué obstáculos nos impiden en la actualidad poder partir del ADN y generar un modelo tridimensional dependiente del tiempo del organismo asociado?

En términos generales, casi todo. El ADN es solo una pequeña parte de toda la información que permite que los seres vivos funcionen. Esto es fácilmente aparente por el hecho de que (en una muy buena aproximación, sé…
¿Por qué las proteínas elaboradas a partir de ribosomas libres funcionan dentro del citosol, mientras que las elaboradas a partir de ribosomas unidos se utilizan para la exportación, el empaquetamiento y la inserción en las membranas?

Las proteínas hechas en el retículo endoplásmico se aíslan del citosol. Se mueven en vesículas al aparato de Golgi donde (entre otras cosas) se clasifican en diferentes tipos de vesículas destinadas a diferentes lugares. La clasificación se basa…
¿Cuál es la diferencia entre la modificación alostérica y la inhibición no competitiva?

La principal diferencia entre los dos mecanismos de una inhibición enzimática (nota: la modificación alostérica no siempre tiene que ver con la inhibición) es el sitio de acción del antagonista (la molécula competitiva / inhibidora). En la modificación…
En biología molecular y genética, ¿la palabra “residuo” se usa indistintamente con “aminoácido” o hay alguna diferencia?

Piensa en esto, de esta manera:- Un aminoácido es una molécula con un grupo amino (NH2) y un grupo ácido (COOH). Esta es la solución de tirosina: Tenga en cuenta la presencia del grupo NH2 (rojo) y COOH…
¿Cuáles son algunos genomas incorrectamente anotados?

Lo más probable es que todos los genomas tengan algunas anotaciones incorrectas, y algunas más que otras, probablemente directamente proporcionales a la secuencia y al esfuerzo bioinformático que implica la unión del genoma específico. Hay áreas como repeticiones…
¿Qué motivos de aminoácidos hacen que una proteína sea susceptible de fosforilación?

Esta es una pregunta difícil. Teniendo en cuenta que la regulación de las proteínas dependiente de la fosforilación está tan extendida y afecta todos los procesos celulares básicos, ¿cómo se puede predecir si un determinado residuo de una…
¿Alguna vez antropomorfizaron inadvertidamente proteínas, productos químicos o pequeñas estructuras inanimadas con las que trabajas?

No, no creo que haya antropomorfizado inadvertidamente químicos, reacciones químicas o dispositivos inanimados. Sin embargo, he antropomorfizado intencionalmente muchas de las anteriores como la mejor forma de entender las propiedades y acciones de los elementos críticos para mi…
¿Cuál es el papel del agua en el plegamiento y la estructura de las proteínas?

Solo quiero señalar que el “efecto hidrofóbico” es uno de los contribuyentes más importantes , si no el más importante, al plegamiento de proteínas. La complejación de las moléculas de agua en la interfaz con los residuos hidrofóbicos…
¿Por qué los parches de aminoácidos hidrofóbicos promueven la agregación de proteínas?

Las proteínas en la célula se encuentran en un entorno acuoso y, por lo general, las superficies hidrófobas están enterradas en lo profundo del pliegue proteico. Sin embargo, algunas proteínas tienen parches hidrofóbicos de superficie que a veces…