Además de la cristalografía de rayos X, ¿cuáles son algunas formas de detectar la unión entre una molécula pequeña y una proteína, y formas de medir la afinidad de unión?

Para energéticos detallados en un pequeño conjunto de moléculas, la calorimetría isotérmica (da Kd, estequiometría, dH, dS). Para seleccionar un gran conjunto de moléculas, interferometría bioloayer (tecnología ForteBio :: BLI) (proporciona tasas aproximadas de encendido / apagado) También…
¿Hay proteínas que tengan contenido de estructura secundaria (hélices y láminas) pero ninguna estructura terciaria?

No lo creo. Las estructuras secundarias son conformaciones estructurales locales que dependen del enlace de hidrógeno, mientras que la forma general tridimensional de una molécula de proteína completa es la estructura terciaria. Es solo formas diferentes de representación.…
¿Los segmentos helicoidales de proteína tienen una secuencia repetitiva de aminoácidos?

Las cremalleras Fos, Jun y Leucine tienen una leucina bien espaciada en su estructura helicoidal … pero no se repite otro aminoácido. Los patrones de repulsión son más relevantes en la proteína beta de hoja de seda. ¿Qué…
Cómo analizar la secuencia de aminoácidos completa o completa de una proteína en particular

Supongo que te refieres a cómo obtienes la secuencia. Esa respuesta ha cambiado a lo largo de los años: durante un tiempo se “cortó” la proteína en fragmentos y se secuenciaron los fragmentos utilizando Edman Degradation. Usando varios…
¿Qué significa la clonación de una proteína?

Lo que se clona es el organismo o línea celular que produce la proteína. Un buen ejemplo sería la bacteria. Si estás clonando una proteína (más exacto para decir que estás clonando el gen, lo más exacto es…
¿Por qué los priones no se desnaturalizan con calor?

Los priones se forman en placas amiloides compuestas de colecciones extremadamente grandes y compactas de hojas beta. Estos agregados son muy energéticamente favorables debido a la configuración de baja energía de las láminas beta, que actúan como una…
¿Cuál es la fórmula de la proteína?

La mayoría de las proteínas consisten en polímeros lineales construidos a partir de series de hasta 20 L-α-aminoácidos diferentes. Todos los aminoácidos proteinogénicos poseen características estructurales comunes, que incluyen un carbono α al que están unidos un grupo…
Este es un polipéptido: AGTRCWPMKGLYCAFAEPGILKYCRQALTWERAGLAFANG. ¿Cuántos polipéptidos se formarán por la acción de quimotripsina y tripsina?

La quimotripsina escinde preferentemente enlaces peptídicos amida en los que el lado carboxilo del enlace amida es un aminoácido aromático. Así que, en esencia, el enlace peptídico al lado (en el lado C) F, W e Y. Así…
¿Cuáles son algunas proteínas recombinantes disponibles comercialmente?

por nombrar algunos, que son clínicamente relevantes Eritropoyetina Filgrastim del factor estimulante de colonias de granulocitos (G-CSF) vendido como Neupogen de Amgen; pegfilgrastim vendido como Neulasta Activador de plasminógeno tisular (TPA) Glucocerebrosidasa Interferón (IF) Factor de crecimiento similar…
¿Por qué pueden aparecer múltiples picos en calor específico aunque la proteína realmente no tenga los correspondientes ‘estados de fase’?

Sin embargo, las proteínas realmente se someten a varias transiciones de pseudo-fase. Estas moléculas suelen estar repletas de regiones altamente organizadas, ya sean bolsas hidrofóbicas, redes de enlaces de hidrógeno en láminas \ beta altamente ordenadas, hélices en…