Supongo que te refieres a cómo obtienes la secuencia. Esa respuesta ha cambiado a lo largo de los años: durante un tiempo se “cortó” la proteína en fragmentos y se secuenciaron los fragmentos utilizando Edman Degradation. Usando varios trucos, podría averiguar cómo los fragmentos volvieron a estar juntos y así obtener la secuencia completa. Luego se hizo mucho más barato y más rápido secuenciar el ADN en lugar de la proteína, por lo que aún usaría la Degradación de Edman para obtener una secuencia corta, y luego usar esa secuencia para encontrar el gen que codifica la proteína y luego secuenciar el ADN para el gen completo aprendiendo así la secuencia de aminoácidos también.
En la actualidad, a tantos organismos se les ha secuenciado genomas completos para que puedas utilizar un enfoque bioinformático. Con BLASTP o algo similar, puedes básicamente “buscar” y encontrar la secuencia de cualquier proteína en cualquier organismo que haya realizado su genoma.
Me doy cuenta de que también podría querer decir “analizar” como al deducir estructuras secundarias y terciarias. Esa es una historia interesante también, pero no tiene tiempo ahora para entrar en ella.
