¿Qué secuencias de aminoácidos confieren rigidez a una proteína?

Cuando pienso en la “rigidez” de las proteínas, pienso en las fibrillas de colágeno. El colágeno es una de las proteínas de matriz extracelular más ubicua, y si bien existen muchos subtipos, los colágenos fibrilares comparten una unidad…
Entre los 500 aminoácidos, ¿por qué solo aparecen 20 en el código genético?

Hay formas en que podríamos eliminar razonablemente muchos aminoácidos de origen biológico como candidatos para los ingredientes de la traducción a polipéptidos. Puede que no encajen fácilmente en un polipéptido completo que sea bastante compacto en la estructura…
¿Cómo comenzó el ARN a codificar proteínas si los aminoácidos y nucleótidos alguna vez fueron independientes el uno del otro?

Recomiendo mucho que lean esto: RNA world – Wikipedia. Brevemente, bajo las “condiciones correctas”, el ARN puede polimerizar espontáneamente y someterse a polimerización dirigida por molde. Además, el ARN puede catalizar la condensación dirigida de plantilla de aminoácidos…
¿Por qué se elimina la penicilina tan rápidamente dada su alta afinidad con las proteínas plasmáticas?

Los probióticos son un tema polémico, me temo. Tienden a ser promovidos vigorosamente por individuos y grupos fuera de la medicina convencional, en lugar de dentro de ella (lo cual he aprendido a interpretar como una señal de…
¿Cuáles son algunos nombres geniales de proteína / enzima?

Las oxidorreductasas pueden hacer algunas reacciones bastante naturales como cortar compuestos fenólicos y volver a unirlos en algunos arreglos interesantes. Las lacasas y peroxidasas pertenecen a esta categoría y se utilizan para hacer que el papel sea más…
¿Qué es el dominio de proteínas?

Hay muchas partes de una proteína, la parte donde se une al objetivo, el sitio catalítico, el sitio alostérico, el sitio inhibidor, etc. Estas partes se pueden dividir en partes llamadas dominios donde varias estructuras plegadas de cadenas…
¿Puede la pepsina hidrolizar una proteína incluso si la proteína no fue desnaturalizada antes por HCl?

La respuesta corta es que no puedo saber con certeza sin ejecutar una batería de experimentos. Aparte de eso, predigo que la pepsina podría hidrolizar proteínas sin desnaturalización previa, pero con una eficacia mucho menor. Este es mi…
¿Las proteínas de la leche se desnaturalizan al calentarlas?

Sí. Cualquier proteína se desnaturalizará (debido a la pérdida de sus estructuras secundaria y terciaria [y cuaternaria en algunas]. El grado de desnaturalización depende del tipo de proteína y de la duración del tratamiento térmico y la temperatura…
¿La prolina es el único aminoácido cíclico?

Sí. De todos los aminoácidos naturales, la prolina es el único aminoácido cíclico.
¿Por qué el EP complejo una energía más baja que E + P en catálisis enzimática en algún diagrama de energía?

Porque en el mundo real, el complejo enzima-producto está en equilibrio con la enzima libre y el producto libre, de hecho es favorable. Cuando Michaelis-Menten derivó su ecuación cinética, asumieron que el producto estaba completamente desasociado de la…