Los aminoácidos que tienen cadenas laterales hidrofóbicas, glicina (Gly), alanina (Ala), valina (Val), leucina (Leu), isoleucina (Ile), prolina (Pro), fenilalanina (Phe), metionina (Met) y triptófano (Trp), es más probable que estén escondidos en el interior de las proteínas donde no entren en contacto con el solvente. Los aminoácidos polares, a menos que estén involucrados en el sitio catalítico de la proteína / enzima, tienden a estar en el exterior de la molécula por la razón opuesta.
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