¿Cuáles son las propiedades químicas de las proteínas?

Desafortunadamente (en realidad, afortunadamente, desafortunadamente para una respuesta simple pero correcta), las proteínas tienen muy pocas cosas en común que sean universalmente ciertas.

1. Consisten en varios aminoácidos.
2. Los aminoácidos son (en su mayoría, habrá, al menos, algunos de este tipo de enlace) enlaces de amida conectados entre el grupo α-amino y el grupo carboxi de dos aminoácidos.

Eso es todo. Otras cosas son MUY comunes, pero no son universalmente ciertas. Estas son características como:

1. Tienen un grupo amino N-terminal libre.
2. Tienen un grupo carboxi C-terminal libre.
3. Tienen [insertar grupo funcional de cadena lateral de aminoácido aquí].

Todas las características químicas dependen de los detalles. Eso significa principalmente qué aminoácidos (y en qué orden, cuántos, etc.) contiene una proteína específica, así como también las modificaciones postraduccionales que se han realizado.

E incluso las propiedades químicas pertenecientes a las dos primeras características universales pueden variar, dependiendo del plegado, la modificación, etc.

Así que déjame ver si puedo configurar tres listas de propiedades químicas que son (1) universalmente verdaderas, (2) casi universales, verdaderas en la práctica, (3) a menudo verdaderas. Los dos últimos dependerán de muchas cosas, pero serán más largos (y probablemente más útiles para la mayoría de los casos). Y estoy absolutamente seguro de que voy a olvidar u omitir algo, así que cualquier ayuda sería apreciada 🙂

Universal Universal True Chemical Properties of Proteins:

1. Pueden arder, agregar calor y oxígeno y puedes oxidarlos.
2. Los enlaces amida se pueden hidrolizar (si la estructura terciaria / cuaternaria o las modificaciones hacen que los enlaces sean inaccesibles, no es posible. Hay agregados resistentes a los ácidos, pero en esos casos la alteración de la estructura lo hace posible).
3. La estructura secundaria / terciaria / cuaternaria se puede interrumpir (los detalles dependerán de la estructura primaria y las posibles modificaciones, pero se puede alterar / cambiar).

Casi universalmente cierto (en la práctica) Propiedades químicas de las proteínas:

1. A menudo puede suponer que la mayoría de los aminoácidos (al menos los 20 más comunes) estarán presentes en una proteína determinada. eso significa que cualquier cosa que sea químicamente verdadera para un grupo funcional de la cadena lateral de cualquiera de esos aminoácidos será cierta para una proteína que los contiene, es decir, (casi) cualquier proteína. Hay demasiadas propiedades químicas para enumerar, pero puedes buscar en google algo de química orgánica y estudiar la química de los ácidos carboxílicos, aminas primarias, aminas secundarias, alcoholes, amidas, guanidinio, tiol, tioéter, benceno, imidazol, fenol, y grupos de indol. Y las diferentes cadenas de hidrocarburos (aunque son mucho menos reactivas, por lo que no son las más interesantes en este contexto).
1. Muchas técnicas de laboratorio comunes en química de proteínas dependen de la reactividad de estas cadenas laterales (es decir, propiedades químicas).
2. El N-terminal puede reaccionar como cualquier otra amina primaria (no cuando sea inaccesible debido a cualquier estructura o modificaciones previas)
3. El C-terminal puede reaccionar como cualquier otro grupo carboxi (se aplican las mismas restricciones que las anteriores)
4. Puedes etiquetarlos covalentemente. Una vez más, los detalles dependen de varias cosas, entre ellas, la secuencia principal (consulte el primer punto sobre la química de las cadenas laterales).

A menudo es cierto (en la práctica) Propiedades químicas de las proteínas:

Quería escribir algo aquí, pero una vez que llegué a esta sección, me di cuenta de que todo se limita a mirar las cadenas laterales y cómo pueden reaccionar. Me estaría repitiendo a mí mismo si dijera, por ejemplo, que a menudo puede oxidarse para formar puentes disulfuro, o que puede ubiquitinate si hay lisina.

Entonces, en lugar de escribir un montón de cosas aquí, me remitiré a algunos sitios web que explican algunas técnicas comunes de química de proteínas. Ellos, por supuesto, confían en las propiedades químicas de las proteínas y suponen (con razón) que la mayoría, si no todas, las proteínas en biología tendrán residuos que permitirán la química en cuestión.

1. Esta es una descripción general de muchas técnicas. Puede buscar en Google cada uno de ellos para obtener información sobre él. También incluye ensayos físicos y químicos y métodos. Si busca en Google cada método, también es probable que obtenga información sobre los tipos de proteínas en las que trabajará (p. Ej., Hidrófobos, cisteína, hélice anfipática, etc.).
2. Este proporciona una visión general de los aminoácidos comunes, algunas modificaciones postraduccionales (que solo son posibles debido a la propiedad química específica de la proteína / aminoácido que se modifica) y se utiliza en algunos de los métodos analíticos utilizados. Es bastante simple, pero de nuevo, puedes buscar en Google cualquier cosa que no creas que sea lo suficientemente minuciosa.
3. Descripción general de Crosslinking and Protein Modification es una página web comercial, por lo que están tratando de vender algo. Sin embargo, obtienes una visión general sencilla de algunas de las cosas que puedes hacer, y puedes obtener un manual de reactivos de entrecruzamiento, ¡así que definitivamente está relacionado con las propiedades químicas!
4. Su madre era química entra en esto desde una perspectiva de lego, y utiliza principalmente proteínas alimentarias como ejemplos (con un título un tanto sexista, pero aún así). Y habla sobre algunas cosas comunes como la desnaturalización ácida, los protones hidrofóbicos / hidrofílicos, etc.

Una vez más, recomendaría que mirara los detalles (como qué propiedades químicas de qué grupos funcionales) y qué química puede aplicar. Y google si necesita saber más sobre la química específica de cualquier técnica dada, hay mucha información sobre la mayoría de ellos.

Espero que esto ayude, a pesar de que no fue una lista sencilla. Pero hacer eso simplificaría demasiado (en mi opinión), y terminaría siendo una verdad a medias.