¿Qué cinasa fosforila la mayor cantidad de proteínas únicas?

Me divertí con la respuesta a esta pregunta. Recurrí a algunos datos sobre combinaciones de quinasa-sustrato identificadas experimentalmente de PhosphositePlus, y encontré algunos datos interesantes:

  • Más de la mitad de todos los sustratos identificados están fosforilados solo por 10 quinasas.
  • > 60% de todos los sustratos identificados son fosforilados solo por 25 quinasas.
  • Estas 25 quinasas cubren casi todos los procesos biológicos (sin decir que los cientos restantes no son importantes).

Aquí hay un desglose de las 10 principales quinasas:

Un resumen de los 10 mejores:

  1. PKACA (9%) – proteína quinasa alfa dependiente de cAMP. Expresión ubicua y fosforila una gran cantidad de sustratos en el citoplasma y el núcleo. 489 sustratos identificados.
  2. PKCA (6%) – Proteína quinasa C alfa. Quinasa dependiente de fosfolípidos y diacilglicerol (DAG) activada por calcio implicada en la regulación positiva y negativa de la proliferación celular, apoptosis, diferenciación, migración y adhesión, hipertrofia cardíaca, angiogénesis, función plaquetaria e inflamación. 341 sustratos identificados.
  3. ERK2 / MAPK1 (6%) – Proteína quinasa activada por mitógeno 1. Componente esencial de la vía de transducción de señal MAP quinasa. 300 sustratos identificados.
  4. CK2A1 (6%) – Subunidad de caseína quinasa II alfa. Regula numerosos procesos celulares, como la progresión del ciclo celular, la apoptosis y la transcripción, así como la infección viral. 289 sustratos identificados.
  5. CDK2 (5%) – Cinasa dependiente de ciclina 2. Esencial para la transición de G1 / S en células en proliferación. 272 sustratos identificados.
  6. CDK1 (5%) – Quinasa dependiente de ciclina 1. Desempeña un papel clave en el control del ciclo celular eucariótico mediante la modulación del ciclo del centrosoma y el inicio mitótico; promueve la transición de G2-M y regula el progreso de G1 y la transición de G1-S a través de la asociación con ciclinas de interfase múltiples. Se requiere en celdas superiores para entrar en fase S y mitosis. 246 sustratos identificados.
  7. Src (4%) – Proto-oncogén tirosina-proteína quinasa Src. Activado después de la participación de muchas clases diferentes de receptores celulares, incluidos los receptores de respuesta inmune, las integrinas y otros receptores de adhesión, las proteínas tirosina quinasas receptoras, los receptores acoplados a la proteína G y los receptores de citocinas. Participa en las vías de señalización que controlan un amplio espectro de actividades biológicas, incluida la transcripción génica, la respuesta inmune, la adhesión celular, la progresión del ciclo celular, la apoptosis, la migración y la transformación. 230 sustratos identificados.
  8. ERK1 / MAPK3 (4%) – Proteína quinasa activada por mitógeno 3. Componente esencial de la vía de transducción de señal MAP quinasa. 204 sustratos identificados.
  9. Akt1 (3%) – RAC-alfa serina / treonina proteína quinasa. Regula muchos procesos, incluidos el metabolismo, la proliferación, la supervivencia celular, el crecimiento y la angiogénesis. 177 sustratos identificados.
  10. Chk1 (3%) – Checkpoint quinasa 1. Requerido para el arresto del ciclo celular mediado por puntos de control y la activación de la reparación del ADN en respuesta a la presencia de daño en el ADN o ADN no replicado. 135 sustratos identificados.

Si estás interesado, un desglose de los mejores 25 quinasas también:

(Me complació ver que PLK1 y Aurora B aparecieron en este, ya que son quinasas mitóticas prominentes).