¿Por qué son 3_10 hélices importantes?

Introducción rápida: 3.10 hélices son motivos de estructura secundaria razonablemente raros que tienen tres residuos por vuelta y por lo tanto 120 grados por residuo. Esto significa que el grupo NH de un residuo de aminoácido forma un enlace de hidrógeno con el grupo CO de un aminoácido a tres posiciones ( i +3 ai ).

Esto está en contraste con la hélice alfa más famosa que tiene 3.6 residuos por vuelta, por lo tanto, 100 grados por residuo. Las hélices alfa tienen un enlace de hidrógeno de +4 a iy las hélices pi tienen un enlace de hidrógeno de +5 a i .

Así que aquí está cómo se ven los tres tipos de hélice:

Créditos de las imágenes: Kurt D. Berndt

Observará que la hélice 3.10 en el medio es sustancialmente más larga, más delgada y más enrollada que los otros tipos (por residuo). Como resultado, 3.10 hélices son menos estables que las hélices alfa y tienden a estar compuestas de menos residuos. Sin embargo, existen más de 3,10 hélices (más de 6 residuos), aunque tienen orden de largo alcance inferior.

Un papel importante para 3.10 es en proteínas de membrana. Un ejemplo de esto es en los canales de potasio dependientes de voltaje, que ayudan a coordinar los potenciales de acción en las neuronas. Se cree que la hélice de detección de voltaje cambia de una hélice alfa a una conformación de hélice de 3.10 como parte de su función, en parte al menos para blindar residuos positivos clave del entorno de la membrana.

Además, 3.10 hélices pueden representar un paso importante en la ruta de la hélice alfa a la espiral, como se observa en la gran cantidad de hélices alfa que adoptan configuraciones híbridas de configuración mixta de hélice alfa y 3.10 hélice, a menudo con la configuración 3.10 en el fin de la hélice

Otras lecturas:
310 hélices en canales y otras proteínas de membrana
Página en dankalia.com
3.1.2 3.10 hélice

Por la misma razón que las hélices alfa o hebras beta, solo menos: las hélices 3-10 son una forma de estructura secundaria clave para el pliegue total de muchas proteínas (solo muchas menos que la hélice alfa, que se encuentra en la mayoría de las proteínas )

Creo que se sabe que la hemaglutinina (la H en la nomenclatura de la gripe) tiene un segmento de hélice 3_10 como parte de su péptido de fusión.