Expandiré un poco la respuesta de Gary Ward. El magnesio parece alcanzar el “punto dulce” en su carga: relación de radio atómico. Esta relación es lo suficientemente alta como para convertirla en un ácido de Lewis decente, y que es un buen cofactor catalítico. El calcio, que tiene la misma carga pero un radio atómico más grande, suele ser 10-100 veces menos efectivo para promover las reacciones de hidrólisis cuando se lo sustituye por magnesio.
Los metales de transición (por ejemplo, manganeso, zinc) tienen una relación de carga: radio demasiado pequeña. Tienden a formar complejos de coordinación muy estables con aminas básicas, particularmente las de los ácidos nucleicos, atrapándolas en conformaciones inactivas. Peor aún, catalizan la hidrólisis indiscriminada del ARN a pH fisiológico.
Aquí hay una figura de un documento que publiqué hace unos 20 años que compara Ca, Mg y Mn en apoyo de las propiedades catalíticas y de unión a sustrato del ARN de RNasa P:
De http://www.jbc.org/content/267/4…
Sin meterse en las malezas (muy densas), el Mg sirve bien en capacidades estructurales y catalíticas, el Ca está bien para la estructura pero es terrible para la catálisis, y Mn simplemente lo mastica todo.