¿Cómo analiza la cristalografía de femtosegundo en serie las estructuras proteicas?

Te recomendaré un papel: doi: 10.1016 / j.abb.2016.03.036 En una palabra, la cristalografía tradicional tiene dos inconvenientes que podrían ser realmente molestos: daño por radiación y el requisito de un tamaño decente del cristal. Los cristalógrafos definitivamente buscan…
¿Cuáles son las diferencias entre las diversas bases de datos de interacción de proteínas?

La respuesta corta es que cada una de estas bases de datos de PPI (interacción proteína-proteína) tiene diferentes métodos y fuentes para los PPI. Los métodos utilizados pueden variar de experimentales a computacionales a algún tipo de combinación…
¿Existe algo común en todas las placas de amiloide que las haga más fáciles de identificar como grupo (como con los anticuerpos monoclonales) en lugar de una por una o es una ilusión?

No creo que sea una ilusión. Este es un tema enorme, un área de investigación muy activa. Es mucho trabajo leer sobre este tipo de materias, divertirse aprendiendo.
¿Cuáles son las aplicaciones más recientes de la microscopía de fuerza atómica en la investigación de proteínas?

En mi opinión, uno de los mayores desarrollos en AFM recientemente es la Microscopía de Fuerza Atómica de Alta Velocidad (HS-AFM). Suponiendo que sepa cómo funciona AFM, la principal diferencia en HS-AFM es el uso de un voladizo…
¿Cómo afectan las modificaciones postraduccionales al plegamiento de proteínas?

Gran pregunta! En resumen, las modificaciones postraduccionales (PTM) desempeñan un papel muy importante en el plegamiento de proteínas. Estamos empezando a comprender la importancia de la glicosilación, la acetilación, la ubiquitinación y la fosforilación, entre otros. En los…
¿Qué motivos estructurales dificultan determinar la estructura de una proteína?

Los dos métodos principales para obtener la estructura proteica son la cristalografía de rayos X (~ 88% de las estructuras de AP) y la espectroscopía de RMN (~ 11%). Ambos tienen sus fortalezas y limitaciones, haciendo que las…
¿Cuánto ayuda a la solución de la estructura de una proteína con la solución de una estructura a otra proteína?

Cristalografía de rayos X: una proteína homóloga que comparte similitud de secuencia con la proteína diana presumiblemente tendrá una estructura similar. Si la proteína está lo suficientemente cerca en secuencia a la proteína diana, las fases conocidas de…
¿Cuánta proteína se requiere para la estructura EM de una proteína en comparación con la cristalografía de rayos X?

TEM puede crear imágenes de moléculas individuales. ¿Qué técnica usarás para preparar la muestra? Si esta técnica funciona, dejando caer ~ 10 microL de solución que contiene las proteínas de membrana en una rejilla TEM y luego dejando…
¿El plegado de proteínas es jerárquico?

No estoy seguro de lo que quiere decir por jerárquico, pero … La respuesta depende de si está hablando de replegamiento, como en un bioquímico que ha desarrollado un desorden de proteínas y lo está viendo replegarse, o…
¿Cuáles son algunas alternativas para FRET en la detección de interacciones proteína-proteína?

Similar a la respuesta del usuario de Quora, pero para un enfoque de mayor rendimiento, querrás hacer selecciones, no pantallas. Con las pantallas fluorescentes está limitado a quizás más de 1000 muestras, mientras que con las selecciones en…