Bioquímica: ¿cómo se mide analíticamente la cantidad de radical hidroxilo en una célula?

Hay pocas sondas mediante las cuales se pueden medir radicales hidroxilo (puede no ser muy específico / preciso debido a su vida media muy corta, 1 × 10 ^ -9 s). Me he encontrado con algunos que enumeré…
¿Qué tan significativo es el apilamiento de bases en la formación y mantenimiento del ADN bicatenario?

He leído mucho sobre la capacidad de apilamiento de bases para estabilizar el ADN de ds y cómo son más importantes que los enlaces de hidrógeno. Por lo tanto, intentaré responder a la segunda parte de su pregunta,…
¿Cómo pudieron los científicos convertir a DsRed, la forma tetramérica de una proteína roja fluorescente, en su forma monomérica (mRed)?

La respuesta completa a esta pregunta está básicamente aquí en este documento de 2002 del laboratorio Tsien: una proteína fluorescente roja monomérica. Aquí hay un resumen: Desventajas de DsRed de origen natural: Maduración lenta e incompleta – Retraso…
¿Por qué Christian Anfisen eligió la ribonucleasa A para probar la hipótesis termodinámica?

No existen propiedades termodinámicas especiales propias de la RNasa A. Las razones para elegirlo fueron muy prácticas. Lo más importante, fue abundante. De la ribonucleasa Un artículo sobre la Wikipedia: La importancia de la RNasa A pancreática bovina…
¿Qué técnica es mejor para identificar una interacción proteína-proteína?

A lo largo de los años, se han desarrollado una gran cantidad de métodos para estudiar las interacciones proteína-proteína, que incluyen Y2H (híbrido de levadura 2), TAP (purificación de afinidad en tándem), Co-IP (Coinmunoprecipitación), ensayos de pull-down, etc.…
¿Cuál es el número mínimo de residuos de aminoácidos en un péptido que se requiere para formar un bolsillo hidrofóbico? ¿Existen buenos sistemas de modelos pequeños para estudiar la formación de tales ambientes hidrofóbicos dentro de la estructura biomolecular?

Depende de lo que quiere decir con “bolsillo”. Pocket implica un sitio de unión estable en la superficie de una proteína. Para los péptidos, que generalmente no tienen estructura terciaria estable, el término “agrupación hidrofóbica” se usa a…
¿KcsA es un canal de potasio dependiente de voltaje?

Se sabe que KcsA está bloqueado por protones (H +). Sin embargo, en 2006 se descubrió que el canal muestra la activación de voltaje independientemente de la activación del protón (activación dependiente del voltaje en el filtro de…
Bioquímica: ¿Por qué la polimerasa Taq es tan termoestable?

Resumen: Muchas proteínas termófilas son estables a altas temperaturas debido a las contribuciones entálpicas. Es decir, más enlaces de hidrógeno / puentes salinos / interacciones no covalentes [1,2]. Los estados nativos de Taq y E. coli Pol I…
Proteínas (bioquímica): ¿Cuál es la importancia de la proteína alfa3D?

Históricamente, fue una de las primeras proteínas diseñadas de novo (en latín significa desde el principio que es una proteína nueva y no solo una modificación de una existente hecha por unas pocas mutaciones) (1) La proteína alfa3D…
Bioquímica: ¿Qué determina si una droga (o producto químico) causa un estrés de curvatura cuando se acumula en la membrana celular?

La curvatura de la membrana es un tema bastante amplio, hay muchas cosas que contribuyen al estrés de la curvatura, incluida la composición de los lípidos. Sin embargo, dado que se refiere a un artículo en particular que…