Hay una pequeña diferencia entre una proteína intrínsecamente desordenada (IDP) y una proteína intrínsecamente no estructurada (IUP):
- El término * desorden * podría significar muchas cosas, la proteína podría ser más flexible y explorar múltiples estados, podría estar parcialmente desordenada, podría contener segmentos de conformaciones de espiral al azar, podría contener ligadores similares a bobinas, etc.
- El término * desestructurado * significa solo una cosa, la falta de estructura 3D o la falta de cualquier orden.
- Una proteína no estructurada es una proteína desordenada, pero una proteína desordenada no necesita ser una proteína no estructurada. Por lo tanto, las IUP son un subconjunto de desplazados internos.
- Sin embargo, esta distinción no es muy estricta. Las proteínas existen como un conjunto de estados similares, no como una estructura. Y una proteína * anormal * mostrará un rango extremadamente amplio de diversidad en estados o propiedades estructurales.
- Además, dos grupos distintos presentaron los términos de forma independiente, Wright y Dyson sugirieron IUP en 1999 (proteínas intrínsecamente no estructuradas: reevaluación de la estructura de la proteína …) y Dunker propuso el término IDP en 2001 (proteína intrínsecamente desordenada). Por lo tanto, hay mucha confusión en la literatura, dependiendo de quién cita los documentos.
- Cualquier proteína que pueda funcionar sin un estado 3D definido o que desafíe el paradigma clásico de función de estructura puede llamarse una proteína intrínsecamente desordenada (IDP) o una proteína intrínsecamente no estructurada (IUP).
- Encontrará muchos documentos que hacen referencia a IDP y IUP como uno. (Página en uga.edu, proteínas con desorden intrínseco no muestran preferencia por la vinculación de chaperón in vivo,)
- Pero si se sabe que una proteína está parcialmente desordenada, debe usar el término IDP en lugar de IUP .
