Si las condiciones que favorecen el despliegue parcial de una proteína pueden mejorar la formación de fibrillas, ¿pueden estas mismas condiciones mejorar también la desagregación de los agregados proteicos?

En general, no. El despliegue parcial expone residuos hidrófobos, que normalmente están enterrados, a la superficie de la proteína. Los residuos hidrófobos se unen y provocan la agregación. Dado que este es un efecto termodinámico no cinético, debes desplegar por completo las proteínas agregadas para que se vuelvan a plegar.