¿Qué significan 3 ‘y 5’ en una estructura de ADN?

Los símbolos 3 ‘y 5’ se refieren al orden de los átomos de carbono en la molécula de desoxirribosa (azúcar) “troncal” (ver el recuadro inferior izquierdo en la imagen a continuación), numerados del 1 al 5.

Los átomos 3 ‘y 5’ son donde los grupos fosfato se unen con las moléculas de azúcar: uno al sitio 3 ‘y uno al sitio 5’ – Los símbolos sirven para indicar la dirección (de la molécula de ADN) en la cual algunos procesos de ADN progresan, como en “hacia el extremo 5”,

Para más detalles, vea el artículo de Wikipedia Nucleótido. Aquí hay una cita relevante:

En cualquier filamento, la orientación química (direccionalidad) de las uniones de cadena se extiende desde el extremo 5 ‘hasta el extremo 3’ (léase: 5 prime-end hasta 3 prime-end) – haciendo referencia a los cinco sitios de carbono en moléculas de azúcar en nucleótidos adyacentes. En una doble hélice, las dos cadenas están orientadas en direcciones opuestas, lo que permite el emparejamiento de bases y la complementariedad entre los pares de bases, todo lo cual es esencial para replicar o transcribir la información codificada que se encuentra en el ADN.

Negrita cursiva agregada para enfatizar.

Si observamos la forma de cadena abierta de un azúcar pentosa, vemos que hay cinco átomos de carbono numerados del 1 al 5. El carbono número 1 se identifica porque está más cerca del grupo carbonilo (R = O) que es el grupo funcional que define la molécula. Los otros átomos de carbono caen en orden una vez que se identifica el número 1.

Estos átomos de carbono retienen sus etiquetas numeradas incluso cuando la molécula se isomeriza en la forma de anillo cerrado. La forma de anillo de la pentosa se usa en los nucleótidos que son los monómeros de los ácidos nucleicos como el ADN.

Los nucleótidos se componen de un azúcar pentosa con un grupo fosfato (PO4) y una de varias bases nitrogenadas posibles, adenina (A), guanina (G), timina (T) y citosina (C) en nucleótidos de ADN.

Un nucleótido está estructurado con el grupo fosfato (PO4) unido al carbono número 5 (5 ‘) del anillo de pentosa, y la base de nitrógeno está unida al carbono número 1 (1’).

Para unir un nucleótido con otro, el 5 ‘fosfato (PO4) forma otro enlace al carbono 3’ del nucleótido contiguo, uniéndolos con un enlace fosfodiéster.

La ADN polimerasa es la enzima que ensambla las cadenas de ADN uniendo el fosfato 5 ‘del nuevo nucleótido al carbono 3’ del último. Entonces, de esta manera, una cadena de ADN siempre se construye a partir de 5 ‘a 3’.

Además, dos cadenas de ADN se unen formando una doble hélice mantenida unida por enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas complementarias de los nucleótidos de cada cadena.

Las cadenas complementarias de ADN son antiparalelas entre sí. Una hebra está boca abajo en relación con la otra, haciendo que la orientación de los carbonos 5 ‘y 3’ de los azúcares pentosas se invierta en una hebra.

La naturaleza antiparalela de las dos cadenas significa que una cadena corre de 5 ‘a 3’, mientras que su complemento es la ejecución inversa de 3 ‘a 5’.

  • ‘(o primo) denota el término principal de la química.
  • Una característica clave de todos los ácidos nucleicos es que tienen dos extremos distintivos: los extremos 5 ‘(5-prime) y 3’ (3-prime). Esta terminología se refiere a los carbonos 5 ‘y 3’ en el azúcar. Tanto para el ADN (mostrado anteriormente) como para el ARN, el extremo 5 ‘porta un fosfato y el extremo 3’ un grupo hidroxilo.
  • El símbolo principal (‘), el símbolo principal doble (“) y el símbolo triple (‴), etc., se usan para designar varias unidades diferentes y para varios otros propósitos en matemáticas, ciencias, lingüística y música. El símbolo principal no debe confundirse con
    wikipedia.org
    apóstrofo, comillas simples, acento agudo o acento grave; el símbolo doble doble no se debe confundir con la comilla doble, la marca ídem o la letra doble apóstrofo. El símbolo principal es muy similar al hebreo geresh, pero en las fuentes modernas el geresh está diseñado para alinearse con las letras hebreas y el símbolo principal no, por lo que no deben intercambiarse. (esto para citado de wikipedia)

Ver, 3 ‘/ 5’ representa el carbono del anillo de pentosa que tiene un grupo -OH libre. Supongamos que hay dos nucleótidos a los que se unirá el grupo fosfato. El grupo fosfato se unirá al grupo -OH en el 5º carbono de un nucleótido (el más bajo de los dos nucleótidos) para formar un enlace fosfoester. Entonces el mismo grupo de fosfato se unirá al grupo -OH en el tercer carbono al otro nucleótido (parte superior de los dos nucleótidos), formando un enlace fosfo-diéster. Supongamos que continuamos de esta manera para formar una cadena de ADN, el grupo -OH del 3º carbono del nucleótido más inferior permanecerá ilimitado o libre (extremo 3 ‘) y el grupo -OH del 5º carbono del nucleótido superior permanecerá libre (5′ fin). Ahora tomando orientación según las preferencias, este filamento puede ser de 3’-5 ‘o 5′-3’. Supongamos que lo tomamos 5′-3 ‘. Ahora supongamos que para un hilo todas las bases nitrogenadas están presentes en el lado derecho. Por lo tanto, para que las bases nitrogenadas de dos cadenas estén en el mismo lado y formen enlaces de hidrógeno, la otra cadena debe colocarse frente a nuestra cadena considerada, manteniendo la misma orientación. Por lo tanto, si un hilo es 5’-3 ‘, el otro es 3′-5’, cuando mantenemos la misma orientación.

Los 5 ‘y 3’ significan “cinco primos” y “tres primos”. El carbono 5 ‘tiene un grupo terminal de fosfato unido a él, mientras que el carbono 3’ tiene un grupo hidroxilo …. Si desea saber más, la wikipedia tiene un artículo realmente bueno sobre ello.

Hola, viste aquí

¿Qué significa 5 ‘y 3’ en cadenas de ADN y ARN?

Gracias:)