Las enzimas lisosomales se denominan colectivamente hidrolasas. La mayoría de las enzimas lisosomales funcionan en el medio ácido y se llaman Hidrolasas Ácidas. Estas enzimas permanecen inactivas dentro de los lisosomas. Están activos cuando son lanzados. Las enzimas lisosomales se clasifican en seis tipos principales. Son 1. Nucleases , 2. Phosphatases, 3. Sulphatases, 4. Lipases, 5. Proteases, 6. Glycosidases.
Las nucleasas actúan sobre los ácidos nucleicos. Hidrolizan ácidos nucleicos en nucleótidos. Las nucleasas son de dos tipos, a saber, ribonucleasa y desoxirribonucleasa.
La ribonucleasa actúa sobre el ARN y la desoxirribonucleasa actúa sobre el ADN.
Las fosfatasas hidrolizan compuestos de fosfato. Las fosfatasas incluyen fosfatasas ácidas y fosfodiesterasas ácidas.
Las sulfatasas descomponen los ésteres de sulfato en fragmentos.
Las lipasas hidrolizan los lípidos en ácidos grasos y glicerol. Incluyen esterasas y fosfolipasas.
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Las proteasas hidrolizan proteínas en aminoácidos. Incluyen catepsina, colagenasa y peptidasas.
Las glicosidasas hidrolizan polisacáridos en monosacáridos.