¿Cómo se determina la secuencia de síntesis de proteínas?

Por la secuencia de ADN. O, en realidad, por la secuencia de ARNm, que está determinada por la secuencia de ADN.

Existen variaciones en diferentes organismos, y hay excepciones (véase, por ejemplo, el elemento SECIS como medio para introducir selenocisteína).

Pero en general, tres bases (ADN y, posteriormente, ARN) codifica un aminoácido. Puede encontrar una tabla para traducir el código genético. Y puede leer un poco sobre este flujo de información, llamado dogma central de la biología molecular.

EDITAR: Supongo que te refieres a la biosíntesis. Si se habla de la síntesis de péptidos sin el uso de ribosomas, entonces (¿usualmente?) Se logra usando grupos de protección. Pero no entraré en eso a menos que sea eso lo que querías decir.