Podría haber una alteración en la estructura secundaria de los transcritos de ARN que se producen a partir de una región de un gen transcrito con uno de los cuatro codones de prolina.
Por ejemplo, un mecanismo de regulación postranscripcional es la formación de horquilla en ARNm. Esencialmente, un ribosoma corre a lo largo de una cadena de ARNm 5 ‘→ 3’, leyendo codones y permitiendo que el ARNt transfiera aminoácidos a la cadena peptídica en crecimiento.
Digamos, sin embargo, que en un punto en el tiempo una célula determinada está “muerta de hambre” de un aminoácido determinado. esto ralentizará la velocidad a la que el ribosoma puede moverse a lo largo del ARNm, ya que tomará más tiempo para que el complejo de ARNt-aminoácido escaso esté disponible.
Esta ralentización puede permitir que se formen estructuras secundarias de ARN, como horquillas para el cabello, que pueden actuar como badenes de velocidad o bloqueos de carreteras, ralentizando la traducción de proteínas o ablapsando por completo una transcripción dada.
Las estructuras secundarias, en este caso las horquillas para el cabello, son en su mayoría el resultado de ácidos nucleicos complementarios. Cambiar un par de bases en un codón, sin embargo, podría permitir o anular esta complementariedad, efectuando de este modo un proceso regulador post-transcripcional.
Respuesta LARGA, pero es un ejemplo de efecto in vivo . Los biólogos moleculares a menudo utilizan este fenómeno en la biología sintética en un proceso conocido como “optimización de codones”, que tiene muchos usos en la ciencia.
