Debido a la diversidad de tipos de células y expresión génica, es difícil determinar qué proteínas interactúan más con otras proteínas. En un organismo, e incluso en una sola célula, la expresión de la proteína varía constantemente.
Para responder la pregunta, “qué proteínas interactúan con la mayor cantidad de otras proteínas”, creo que la respuesta más probable es que las proteínas directamente involucradas en el mantenimiento del equilibrio síntesis-degradación son las proteínas que interactúan más con otras proteínas.
Lo más probable es que las proteínas involucradas en la síntesis de otras proteínas interactúen más con otras proteínas. Ejemplos de proteínas utilizadas en la síntesis de proteínas son las proteínas ribosómicas: los ribosomas están compuestos de ~ 65% de ARNr y ~ 35% de proteína.
Como efectivamente todas las proteínas deben ser sintetizadas por los ribosomas, todas las proteínas interactúan con las proteínas ribosómicas en algún momento.
Otro posible grupo de proteínas que interactúa más con otras proteínas son aquellas proteínas involucradas en la proteólisis mediada por ubiquitina.
Estas proteínas incluyen aquellos péptidos que constituyen proteasomas y proteasas.
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En el equilibrio dinámico de la expresión proteica, los proteasomas son responsables de descomponer casi todas las proteínas dentro de una célula viva. Sin embargo, algunas proteínas que se secretan a la matriz extracelular (por ejemplo, colágeno) o se excretan (queratinas en el cabello y proteínas intestinales en las heces) no se descomponen, por lo que las proteínas proteasas no interactúan con ellas.
Por lo tanto, creo que es más probable que las proteínas ribosomales sean las proteínas que interactúan más con otras proteínas.
