¿La metilación del ADN y la acetilación de histonas se agregan a los aminoácidos de la histona o el nucleótido?

Sí, estas son modificaciones covalentes hechas a un nucleótido (metilación del ADN) o un aminoácido (acetilación de histonas).

El tipo más común de metilación del ADN es la metilación de citosina, donde un grupo metilo (CH3) se transfiere a la quinta posición de la base de citosina. Algunas especies también metilan adenosina, aunque esto es considerablemente más raro que la metilación de la citosina.

La acetilación de histonas agrega un grupo acetilo a un residuo de lisina accesible en una histona. Estas reacciones son catalizadas por enzimas llamadas (curiosamente) histonas acetil transferasas, que generalmente muestran especificidad por aminoácidos individuales de histonas.

La acetilación de histonas y otras modificaciones de histonas agregan moléculas a los aminoácidos de la histona.

La metilación del ADN agrega moléculas directamente a las bases de nucleótidos del ADN. (El ADN no contiene aminoácidos)

La metilación puede ocurrir con cualquiera de los dos, pero las histonas son el objetivo más común de las modificaciones epigenéticas (acetilación, metilación, otras).