Depende de la aplicación industrial. Tomemos una perspectiva futurista. Estas son aplicaciones potenciales si introduce la biología sintética a la biotecnología actual que emplea enzimas en aplicaciones industriales.
Digamos que queremos producir antibióticos en masa a partir de materias primas, como aminoácidos. Esto requiere muchas modificaciones enzimáticas. Lo que puedes hacer es diseñar las enzimas apropiadas (ej. Evolución dirigida) para poder unir covalentemente a una superficie o cuentas, luego ejecutar los substratos apropiados en fase acuosa a través de la superficie oa través de columnas de cuentas (para mayor control) y algunas de su producto final será el antibiótico que desee. Con la optimización, esto posiblemente puede ampliarse.
Digamos que queremos convertir fibra simple de lignina y celulosa (que se encuentra solubilizada en aguas residuales de fábricas de pasta y papel) en productos de alto valor basados en carbohidratos. Puede rediseñar las enzimas para poder hacer nuevas modificaciones covalentes que antes no eran posibles, lo que también podría hacerse a través de la evolución dirigida. La combinación de estas enzimas recombinantes con aguas residuales en biorreactores puede producir en masa productos de alto valor.
Ambos requieren más investigación, pero tienen el potencial de mejorar las tecnologías industriales actuales basadas en enzimas y abrir nuevos mercados si se optimizan y amplían.