¿Es posible analizar los resultados de Western Blot sin control interno?

Sí, los controles internos a veces pueden cambiar con tu tratamiento. Eso apesta. Western Blot tiene este problema intrínsecamente.
La tinción de Ponceau ayuda, pero no es tan precisa.

Lo que realmente quiere es asegurarse de que sus extractos sean de la misma cantidad de células para cada tratamiento. De esta forma, sabrá que está analizando los cambios en la expresión de proteínas por célula, que es lo que realmente le interesa.

O cuantifique imágenes de inmuno fluorescencia, si tiene microscopios, software de análisis y anticuerpos adecuados para esto.

Puede probar VDAC o lamin B1. Estos se usan generalmente como controles internos mientras que las fracciones mitocondrial y nuclear respectivamente. Supongo que has estado usando WCL. Sin embargo, como señaló Akshari, no encontré artículos (búsqueda limitada) donde los niveles de actina / tubulina están cambiando después del tratamiento.

¡Buena suerte!

Cuando estamos pegados, usamos una imagen de la membrana manchada con Ponceau como control de carga.