Para posiblemente aclarar la pregunta, Protiens (y otros polímeros) pueden desnaturalizarse. La glutamina no es un polímero. Técnicamente es un monómero o una unidad repetible en un polímero conocido como proteína, en este caso.
Entonces, ¿qué significa desnaturalizar? Básicamente se refiere a un proceso que cambia la forma de una proteína. Ver: desnaturalización (bioquímica)
Así que, como dijo Sean, no creo que destruyas la bondad de la glutamina al calentar tus pizzas cursis 😉