Cómo medir las cantidades y los diferentes tipos de bacterias, por ejemplo cuando se fermenta

Para observar la cantidad de bacterias en una muestra, puede colocar diluciones seriales en varios medios de agar (y luego hacer los cálculos para calcular cuántos estaban en la muestra original).

Sin embargo, cualquier enfoque basado en el cultivo debe considerar la selección de qué medios usar para el recubrimiento y si las bacterias que intenta aislar crecerán en él. Dado que se trata de una muestra conocida (de una fermentación), es probable que tenga una buena idea de qué temperatura usar, qué fuente de carbono le gustaría a las bacterias cultivar, etc. (Si le interesan solo las bacterias en el muestra, es posible que desee agregar un medicamento antifúngico a los medios de cultivo).

Para evitar el problema del sesgo de cultivo, se pueden usar métodos independientes del cultivo (microscopía, varios enfoques de secuenciación profunda (costosos, si el costo es un problema)).

Para medir los diferentes tipos de bacterias en la muestra, es posible que pueda llegar a algún lugar simplemente observando la morfología de la colonia y la capacidad de crecer en diversos medios indicadores, o varias pruebas bioquímicas (básicamente microbiología general 101 – identificar un desconocido – ver prácticamente cualquier manual introductorio de laboratorio). Si el costo no es un problema, entonces, por supuesto, puede obtener mucho más utilizando un enfoque de secuenciación profunda e identificar las diversas especies presentes por 16S u otros marcadores genéticos.

Normalmente no le presto mucha atención al costo de los suministros de laboratorio, así que cualquier intento de adivinar el precio es solo una suposición … Suponiendo que no tenga que comprar un autoclave para esterilizar cosas, probablemente podría Haga esto con un presupuesto de cien libras más o menos, para las placas, varios componentes de medios, puntas de pipeta, etc., todo dependiendo de cuánto tenga en términos de equipos de laboratorio y suministros. Si sigues la ruta de secuenciación, probablemente termines gastando mil libras más o menos.

Las pruebas de bacterias pueden determinar los tipos y números (en términos de unidades formadoras de colonias) de bacterias presentes en una muestra. Las pruebas podrían centrarse en un tipo específico de bacteria, bacteria médica o una amplia
rango de bacterias ambientales.
Dado que las bacterias están presentes en prácticamente cualquier entorno,
es importante tener claro por qué se realizan las pruebas. Cuanto más específica sea la prueba, mejor y más fácil será interpretar los resultados. Números y tipos
de bacterias que deberían ser motivo de preocupación depende
sobre varios factores, incluyendo el tipo de bacteria presente y el tipo de muestras.

Recuento de placas aeróbicas
El recuento de placa aeróbica (APC) indica el nivel de microorganismos en un producto y es una estimación de
las bacterias aeróbicas viables totales presentes en una muestra de
materia prima, material en proceso o producto terminado.
También conocido como el conteo de placa estándar (SPC),
se puede utilizar para evaluar la carga bacteriana total de un
producto.

Recuento de placas anaeróbicas (AnPC)
Esta prueba se usa para determinar el número total de
bacterias anaeróbicas (es decir, bacterias que no requieren oxígeno)
presente a temperaturas mesofílicas (30 ° C-37 ° C).
Los ejemplos de tales tipos de bacterias incluyen Clostridium
spp. La mayoría de los patógenos bacterianos humanos son facultativos
anaerobios y pueden aparecer en esta prueba también.

Para confirmar la identificación de la bacteria detectada y enumerada. Realizar la tinción de Gram. Puede decidir continuar y también hacer pruebas bioquímicas o secuencias API y 16S para identificar más a las bacterias.

En cuanto al costo, no es mucho si tienes los elementos básicos como incubadora, flujo laminar, autoclave, etc.
Árbitro:

Raya una placa de agar. Incubar. Contar. Aislar las colonias e incubarlas por separado. Contar. Hacer un cálculo