Todos los aminoácidos son polares porque todos ellos contienen ácido carboxílico y grupos funcionales amino.
Todos ellos difieren en función de su grupo “R”, o cadena lateral, que afecta en gran medida sus propiedades e interacciones en los enlaces peptídicos y en la estructura proteica general. La estructura básica de un aminoácido está abajo:
Las cadenas laterales no polares solo contienen carbono e hidrógeno. Las cadenas laterales polares contienen O, N, S, etc. Básicamente cualquier compuesto que sea significativamente electronegativo.
Los aminoácidos de la cadena lateral no polar son:
- Alanina (cadena lateral de metilo)
- Glicina (cadena lateral de hidrógeno)
- Isoleucina (cadena lateral de alquilo)
- Leucina (cadena lateral de alquilo)
- Valina (cadena lateral de alquilo)
- Proline (cadena lateral de cicloalcano *)
- Fenilalanina (cadena lateral de benceno)
* Proline es el único caso de aminoácidos donde su “cadena lateral” en realidad gira nuevamente y está unida al nitrógeno amino como se puede ver a continuación:
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Las cadenas laterales polares son un poco más complicadas de describir, así que adjuntaré una imagen de los grupos de cadenas laterales polares a continuación:
Los aminoácidos enumerados anteriormente no abarcan los 20 aminoácidos comunes. También hay cadenas laterales aromáticas , cadenas laterales cargadas negativamente y cadenas laterales cargadas positivamente , la mayoría de las cuales son también cadenas laterales polares (excluida la fenilalanina).