¿Qué es un grupo alquilo polar y no polar en aminoácidos?

Todos los aminoácidos son polares porque todos ellos contienen ácido carboxílico y grupos funcionales amino.

Todos ellos difieren en función de su grupo “R”, o cadena lateral, que afecta en gran medida sus propiedades e interacciones en los enlaces peptídicos y en la estructura proteica general. La estructura básica de un aminoácido está abajo:

Las cadenas laterales no polares solo contienen carbono e hidrógeno. Las cadenas laterales polares contienen O, N, S, etc. Básicamente cualquier compuesto que sea significativamente electronegativo.

Los aminoácidos de la cadena lateral no polar son:

  • Alanina (cadena lateral de metilo)
  • Glicina (cadena lateral de hidrógeno)
  • Isoleucina (cadena lateral de alquilo)
  • Leucina (cadena lateral de alquilo)
  • Valina (cadena lateral de alquilo)
  • Proline (cadena lateral de cicloalcano *)
  • Fenilalanina (cadena lateral de benceno)

* Proline es el único caso de aminoácidos donde su “cadena lateral” en realidad gira nuevamente y está unida al nitrógeno amino como se puede ver a continuación:

Las cadenas laterales polares son un poco más complicadas de describir, así que adjuntaré una imagen de los grupos de cadenas laterales polares a continuación:

Los aminoácidos enumerados anteriormente no abarcan los 20 aminoácidos comunes. También hay cadenas laterales aromáticas , cadenas laterales cargadas negativamente y cadenas laterales cargadas positivamente , la mayoría de las cuales son también cadenas laterales polares (excluida la fenilalanina).

En mi propio trabajo, sinteticé análogos de aminoácidos que contienen boro. Como la química de mi trabajo podía reaccionar con porciones polares o heteroátómicas de cadenas laterales de aminoácidos, tuve que seleccionar la menos reactiva. Esto incluía todas las cadenas laterales de alquilo.

Esta es la lista, excluyendo la glicina, ya que la cadena lateral es simplemente otro hidrógeno.

Alanina (metilo)

valina ( iso -propil- o 2-propil-)

leucina ( iso -butilo o 2-metil-1-propilo)

isoleucina (2-butilo)

fenilalanina (bencilo o fenilmetilo)

Polar más o menos significa los otros aminoácidos con lugares para la solvatación por moléculas de agua a través principalmente de enlaces de hidrógeno. Esto incluiría ejemplos tales como triptófano, ácido glutámico, asparagina y prolina.